Protein–RNA interactions for Protein: P51943

Ccna2, Cyclin-A2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna2P51943 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccna2P51943 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccna2P51943 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccna2P51943 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccna2P51943 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccna2P51943 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccna2P51943 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccna2P51943 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccna2P51943 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccna2P51943 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccna2P51943 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccna2P51943 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccna2P51943 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccna2P51943 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccna2P51943 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccna2P51943 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccna2P51943 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccna2P51943 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccna2P51943 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccna2P51943 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccna2P51943 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccna2P51943 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccna2P51943 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccna2P51943 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccna2P51943 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccna2P51943 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccna2P51943 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccna2P51943 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccna2P51943 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccna2P51943 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccna2P51943 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccna2P51943 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccna2P51943 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccna2P51943 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccna2P51943 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccna2P51943 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccna2P51943 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccna2P51943 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccna2P51943 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccna2P51943 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccna2P51943 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccna2P51943 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccna2P51943 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccna2P51943 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccna2P51943 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccna2P51943 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccna2P51943 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccna2P51943 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccna2P51943 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccna2P51943 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccna2P51943 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccna2P51943 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccna2P51943 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccna2P51943 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccna2P51943 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccna2P51943 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccna2P51943 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccna2P51943 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccna2P51943 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccna2P51943 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccna2P51943 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccna2P51943 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccna2P51943 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccna2P51943 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccna2P51943 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccna2P51943 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccna2P51943 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccna2P51943 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccna2P51943 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccna2P51943 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccna2P51943 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccna2P51943 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccna2P51943 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccna2P51943 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccna2P51943 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccna2P51943 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccna2P51943 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccna2P51943 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccna2P51943 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccna2P51943 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccna2P51943 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccna2P51943 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccna2P51943 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccna2P51943 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccna2P51943 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccna2P51943 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccna2P51943 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccna2P51943 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccna2P51943 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccna2P51943 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccna2P51943 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccna2P51943 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccna2P51943 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccna2P51943 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccna2P51943 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccna2P51943 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccna2P51943 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccna2P51943 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccna2P51943 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccna2P51943 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms