Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpc4P51655 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpc4P51655 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gpc4P51655 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gpc4P51655 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gpc4P51655 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpc4P51655 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpc4P51655 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpc4P51655 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gpc4P51655 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gpc4P51655 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gpc4P51655 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpc4P51655 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpc4P51655 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpc4P51655 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gpc4P51655 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gpc4P51655 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gpc4P51655 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gpc4P51655 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gpc4P51655 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gpc4P51655 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gpc4P51655 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gpc4P51655 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gpc4P51655 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gpc4P51655 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gpc4P51655 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gpc4P51655 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gpc4P51655 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gpc4P51655 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gpc4P51655 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gpc4P51655 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gpc4P51655 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gpc4P51655 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gpc4P51655 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gpc4P51655 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gpc4P51655 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gpc4P51655 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gpc4P51655 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gpc4P51655 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gpc4P51655 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gpc4P51655 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gpc4P51655 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gpc4P51655 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gpc4P51655 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gpc4P51655 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gpc4P51655 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gpc4P51655 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gpc4P51655 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gpc4P51655 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gpc4P51655 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gpc4P51655 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gpc4P51655 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gpc4P51655 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gpc4P51655 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gpc4P51655 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gpc4P51655 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gpc4P51655 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gpc4P51655 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gpc4P51655 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gpc4P51655 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gpc4P51655 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gpc4P51655 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gpc4P51655 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gpc4P51655 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gpc4P51655 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gpc4P51655 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gpc4P51655 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gpc4P51655 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gpc4P51655 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gpc4P51655 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpc4P51655 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpc4P51655 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpc4P51655 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpc4P51655 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpc4P51655 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpc4P51655 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpc4P51655 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpc4P51655 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpc4P51655 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpc4P51655 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpc4P51655 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpc4P51655 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpc4P51655 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpc4P51655 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpc4P51655 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpc4P51655 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpc4P51655 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gpc4P51655 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpc4P51655 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpc4P51655 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpc4P51655 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpc4P51655 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpc4P51655 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpc4P51655 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gpc4P51655 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gpc4P51655 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gpc4P51655 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gpc4P51655 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gpc4P51655 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gpc4P51655 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms