Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CntfP51642 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CntfP51642 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CntfP51642 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CntfP51642 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CntfP51642 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CntfP51642 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CntfP51642 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CntfP51642 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CntfP51642 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CntfP51642 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CntfP51642 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CntfP51642 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CntfP51642 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CntfP51642 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CntfP51642 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CntfP51642 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CntfP51642 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CntfP51642 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CntfP51642 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CntfP51642 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CntfP51642 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CntfP51642 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CntfP51642 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CntfP51642 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CntfP51642 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CntfP51642 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CntfP51642 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CntfP51642 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CntfP51642 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CntfP51642 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CntfP51642 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CntfP51642 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CntfP51642 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CntfP51642 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CntfP51642 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CntfP51642 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CntfP51642 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CntfP51642 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CntfP51642 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CntfP51642 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CntfP51642 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CntfP51642 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CntfP51642 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CntfP51642 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CntfP51642 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CntfP51642 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CntfP51642 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CntfP51642 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CntfP51642 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CntfP51642 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CntfP51642 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CntfP51642 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CntfP51642 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CntfP51642 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CntfP51642 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CntfP51642 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CntfP51642 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CntfP51642 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CntfP51642 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CntfP51642 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CntfP51642 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CntfP51642 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CntfP51642 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CntfP51642 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CntfP51642 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CntfP51642 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CntfP51642 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CntfP51642 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CntfP51642 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CntfP51642 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CntfP51642 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CntfP51642 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CntfP51642 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CntfP51642 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CntfP51642 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CntfP51642 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CntfP51642 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CntfP51642 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CntfP51642 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CntfP51642 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CntfP51642 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CntfP51642 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CntfP51642 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CntfP51642 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CntfP51642 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CntfP51642 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CntfP51642 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CntfP51642 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CntfP51642 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CntfP51642 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CntfP51642 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CntfP51642 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CntfP51642 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CntfP51642 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CntfP51642 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CntfP51642 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CntfP51642 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CntfP51642 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CntfP51642 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms