Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Opn1swP51491 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Opn1swP51491 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Opn1swP51491 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Opn1swP51491 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Opn1swP51491 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Opn1swP51491 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Opn1swP51491 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Opn1swP51491 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Opn1swP51491 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Opn1swP51491 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Opn1swP51491 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Opn1swP51491 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Opn1swP51491 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Opn1swP51491 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Opn1swP51491 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Opn1swP51491 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Opn1swP51491 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Opn1swP51491 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Opn1swP51491 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Opn1swP51491 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Opn1swP51491 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Opn1swP51491 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Opn1swP51491 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Opn1swP51491 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Opn1swP51491 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Opn1swP51491 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Opn1swP51491 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Opn1swP51491 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Opn1swP51491 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Opn1swP51491 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Opn1swP51491 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Opn1swP51491 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Opn1swP51491 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Opn1swP51491 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Opn1swP51491 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Opn1swP51491 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Opn1swP51491 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Opn1swP51491 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Opn1swP51491 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Opn1swP51491 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Opn1swP51491 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Opn1swP51491 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Opn1swP51491 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Opn1swP51491 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Opn1swP51491 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Opn1swP51491 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Opn1swP51491 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Opn1swP51491 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Opn1swP51491 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Opn1swP51491 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Opn1swP51491 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Opn1swP51491 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Opn1swP51491 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Opn1swP51491 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Opn1swP51491 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Opn1swP51491 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Opn1swP51491 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Opn1swP51491 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Opn1swP51491 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Opn1swP51491 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Opn1swP51491 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Opn1swP51491 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Opn1swP51491 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Opn1swP51491 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Opn1swP51491 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Opn1swP51491 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Opn1swP51491 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Opn1swP51491 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Opn1swP51491 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Opn1swP51491 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Opn1swP51491 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Opn1swP51491 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Opn1swP51491 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Opn1swP51491 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Opn1swP51491 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Opn1swP51491 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Opn1swP51491 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Opn1swP51491 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Opn1swP51491 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Opn1swP51491 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Opn1swP51491 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Opn1swP51491 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Opn1swP51491 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Opn1swP51491 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Opn1swP51491 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Opn1swP51491 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Opn1swP51491 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Opn1swP51491 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Opn1swP51491 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Opn1swP51491 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Opn1swP51491 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Opn1swP51491 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Opn1swP51491 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Opn1swP51491 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Opn1swP51491 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Opn1swP51491 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Opn1swP51491 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Opn1swP51491 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Opn1swP51491 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms