Protein–RNA interactions for Protein: P50711

Defa13, Alpha-defensin 13, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa13P50711 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa13P50711 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa13P50711 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa13P50711 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa13P50711 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa13P50711 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa13P50711 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa13P50711 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa13P50711 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa13P50711 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa13P50711 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa13P50711 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa13P50711 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Defa13P50711 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Defa13P50711 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa13P50711 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa13P50711 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Defa13P50711 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Defa13P50711 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa13P50711 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Defa13P50711 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa13P50711 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Defa13P50711 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa13P50711 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa13P50711 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Defa13P50711 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa13P50711 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa13P50711 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa13P50711 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Defa13P50711 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa13P50711 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Defa13P50711 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Defa13P50711 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa13P50711 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa13P50711 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa13P50711 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa13P50711 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa13P50711 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa13P50711 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Defa13P50711 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa13P50711 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa13P50711 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa13P50711 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa13P50711 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa13P50711 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa13P50711 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa13P50711 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa13P50711 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa13P50711 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa13P50711 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa13P50711 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa13P50711 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa13P50711 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa13P50711 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa13P50711 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa13P50711 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa13P50711 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa13P50711 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa13P50711 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa13P50711 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa13P50711 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa13P50711 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa13P50711 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa13P50711 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa13P50711 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa13P50711 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa13P50711 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa13P50711 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa13P50711 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa13P50711 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa13P50711 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa13P50711 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa13P50711 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa13P50711 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa13P50711 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa13P50711 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa13P50711 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa13P50711 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa13P50711 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa13P50711 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa13P50711 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa13P50711 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa13P50711 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa13P50711 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa13P50711 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa13P50711 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa13P50711 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa13P50711 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa13P50711 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa13P50711 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa13P50711 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa13P50711 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa13P50711 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa13P50711 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa13P50711 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa13P50711 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa13P50711 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa13P50711 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa13P50711 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Defa13P50711 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms