Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Epb42P49222 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Epb42P49222 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Epb42P49222 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Epb42P49222 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Epb42P49222 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Epb42P49222 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Epb42P49222 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Epb42P49222 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Epb42P49222 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Epb42P49222 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Epb42P49222 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Epb42P49222 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Epb42P49222 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Epb42P49222 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Epb42P49222 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Epb42P49222 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Epb42P49222 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Epb42P49222 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Epb42P49222 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Epb42P49222 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Epb42P49222 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Epb42P49222 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Epb42P49222 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Epb42P49222 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Epb42P49222 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Epb42P49222 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Epb42P49222 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Epb42P49222 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Epb42P49222 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Epb42P49222 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Epb42P49222 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Epb42P49222 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Epb42P49222 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Epb42P49222 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Epb42P49222 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Epb42P49222 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Epb42P49222 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Epb42P49222 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Epb42P49222 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Epb42P49222 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Epb42P49222 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Epb42P49222 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Epb42P49222 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Epb42P49222 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Epb42P49222 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Epb42P49222 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Epb42P49222 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Epb42P49222 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Epb42P49222 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Epb42P49222 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Epb42P49222 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Epb42P49222 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Epb42P49222 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Epb42P49222 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Epb42P49222 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Epb42P49222 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Epb42P49222 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Epb42P49222 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Epb42P49222 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Epb42P49222 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Epb42P49222 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Epb42P49222 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Epb42P49222 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Epb42P49222 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Epb42P49222 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Epb42P49222 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Epb42P49222 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Epb42P49222 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Epb42P49222 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Epb42P49222 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Epb42P49222 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Epb42P49222 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Epb42P49222 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Epb42P49222 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Epb42P49222 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Epb42P49222 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Epb42P49222 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Epb42P49222 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Epb42P49222 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Epb42P49222 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Epb42P49222 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Epb42P49222 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Epb42P49222 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Epb42P49222 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Epb42P49222 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Epb42P49222 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Epb42P49222 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Epb42P49222 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Epb42P49222 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Epb42P49222 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Epb42P49222 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Epb42P49222 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Epb42P49222 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Epb42P49222 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Epb42P49222 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Epb42P49222 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Epb42P49222 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Epb42P49222 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Epb42P49222 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms