Protein–RNA interactions for Protein: P47857

Pfkm, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfkmP47857 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PfkmP47857 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PfkmP47857 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PfkmP47857 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PfkmP47857 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PfkmP47857 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PfkmP47857 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PfkmP47857 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PfkmP47857 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PfkmP47857 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PfkmP47857 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PfkmP47857 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PfkmP47857 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PfkmP47857 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PfkmP47857 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PfkmP47857 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PfkmP47857 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PfkmP47857 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PfkmP47857 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PfkmP47857 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PfkmP47857 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PfkmP47857 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
PfkmP47857 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PfkmP47857 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PfkmP47857 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PfkmP47857 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PfkmP47857 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PfkmP47857 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PfkmP47857 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PfkmP47857 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PfkmP47857 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PfkmP47857 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PfkmP47857 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PfkmP47857 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PfkmP47857 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PfkmP47857 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PfkmP47857 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PfkmP47857 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PfkmP47857 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PfkmP47857 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PfkmP47857 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PfkmP47857 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PfkmP47857 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PfkmP47857 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PfkmP47857 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PfkmP47857 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PfkmP47857 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PfkmP47857 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PfkmP47857 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PfkmP47857 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PfkmP47857 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PfkmP47857 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PfkmP47857 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PfkmP47857 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PfkmP47857 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PfkmP47857 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PfkmP47857 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PfkmP47857 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PfkmP47857 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PfkmP47857 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PfkmP47857 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PfkmP47857 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PfkmP47857 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PfkmP47857 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PfkmP47857 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PfkmP47857 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PfkmP47857 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PfkmP47857 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PfkmP47857 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PfkmP47857 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PfkmP47857 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PfkmP47857 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PfkmP47857 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PfkmP47857 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PfkmP47857 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PfkmP47857 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PfkmP47857 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PfkmP47857 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PfkmP47857 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PfkmP47857 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PfkmP47857 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PfkmP47857 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PfkmP47857 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PfkmP47857 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PfkmP47857 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PfkmP47857 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PfkmP47857 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PfkmP47857 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PfkmP47857 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PfkmP47857 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PfkmP47857 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PfkmP47857 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PfkmP47857 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PfkmP47857 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PfkmP47857 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PfkmP47857 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PfkmP47857 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PfkmP47857 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PfkmP47857 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PfkmP47857 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms