Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx2-2P42586 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx2-2P42586 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx2-2P42586 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx2-2P42586 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx2-2P42586 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx2-2P42586 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-2P42586 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nkx2-2P42586 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx2-2P42586 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx2-2P42586 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx2-2P42586 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx2-2P42586 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nkx2-2P42586 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nkx2-2P42586 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx2-2P42586 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx2-2P42586 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx2-2P42586 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx2-2P42586 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx2-2P42586 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx2-2P42586 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx2-2P42586 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx2-2P42586 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx2-2P42586 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-2P42586 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx2-2P42586 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx2-2P42586 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx2-2P42586 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx2-2P42586 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx2-2P42586 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx2-2P42586 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx2-2P42586 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx2-2P42586 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx2-2P42586 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx2-2P42586 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx2-2P42586 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx2-2P42586 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx2-2P42586 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nkx2-2P42586 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nkx2-2P42586 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nkx2-2P42586 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nkx2-2P42586 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nkx2-2P42586 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nkx2-2P42586 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx2-2P42586 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nkx2-2P42586 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx2-2P42586 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nkx2-2P42586 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nkx2-2P42586 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nkx2-2P42586 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx2-2P42586 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx2-2P42586 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nkx2-2P42586 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkx2-2P42586 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nkx2-2P42586 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nkx2-2P42586 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nkx2-2P42586 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx2-2P42586 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nkx2-2P42586 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nkx2-2P42586 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx2-2P42586 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx2-2P42586 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nkx2-2P42586 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx2-2P42586 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx2-2P42586 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nkx2-2P42586 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nkx2-2P42586 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nkx2-2P42586 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nkx2-2P42586 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nkx2-2P42586 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx2-2P42586 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nkx2-2P42586 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx2-2P42586 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx2-2P42586 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nkx2-2P42586 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nkx2-2P42586 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkx2-2P42586 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkx2-2P42586 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nkx2-2P42586 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx2-2P42586 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx2-2P42586 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nkx2-2P42586 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx2-2P42586 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx2-2P42586 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nkx2-2P42586 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-2P42586 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-2P42586 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-2P42586 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-2P42586 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-2P42586 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-2P42586 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nkx2-2P42586 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nkx2-2P42586 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nkx2-2P42586 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-2P42586 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-2P42586 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-2P42586 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx2-2P42586 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx2-2P42586 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-2P42586 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms