Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Elk1P41969 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Elk1P41969 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Elk1P41969 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Elk1P41969 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Elk1P41969 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Elk1P41969 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Elk1P41969 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Elk1P41969 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Elk1P41969 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Elk1P41969 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Elk1P41969 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Elk1P41969 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Elk1P41969 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Elk1P41969 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Elk1P41969 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Elk1P41969 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Elk1P41969 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Elk1P41969 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Elk1P41969 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Elk1P41969 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Elk1P41969 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Elk1P41969 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Elk1P41969 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Elk1P41969 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Elk1P41969 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Elk1P41969 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Elk1P41969 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Elk1P41969 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Elk1P41969 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Elk1P41969 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Elk1P41969 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Elk1P41969 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Elk1P41969 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Elk1P41969 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Elk1P41969 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Elk1P41969 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Elk1P41969 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Elk1P41969 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Elk1P41969 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Elk1P41969 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Elk1P41969 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Elk1P41969 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Elk1P41969 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Elk1P41969 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Elk1P41969 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Elk1P41969 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Elk1P41969 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Elk1P41969 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Elk1P41969 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Elk1P41969 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Elk1P41969 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Elk1P41969 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Elk1P41969 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Elk1P41969 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Elk1P41969 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Elk1P41969 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Elk1P41969 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Elk1P41969 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Elk1P41969 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Elk1P41969 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Elk1P41969 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Elk1P41969 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Elk1P41969 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Elk1P41969 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Elk1P41969 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Elk1P41969 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Elk1P41969 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Elk1P41969 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Elk1P41969 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Elk1P41969 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Elk1P41969 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Elk1P41969 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Elk1P41969 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Elk1P41969 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Elk1P41969 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Elk1P41969 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Elk1P41969 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Elk1P41969 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Elk1P41969 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Elk1P41969 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Elk1P41969 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Elk1P41969 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Elk1P41969 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Elk1P41969 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Elk1P41969 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Elk1P41969 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Elk1P41969 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Elk1P41969 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Elk1P41969 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Elk1P41969 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Elk1P41969 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Elk1P41969 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Elk1P41969 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Elk1P41969 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Elk1P41969 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Elk1P41969 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Elk1P41969 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Elk1P41969 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Elk1P41969 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms