Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upk2P38575 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Upk2P38575 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Upk2P38575 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Upk2P38575 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Upk2P38575 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Upk2P38575 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Upk2P38575 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Upk2P38575 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upk2P38575 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Upk2P38575 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Upk2P38575 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Upk2P38575 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Upk2P38575 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Upk2P38575 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upk2P38575 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Upk2P38575 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Upk2P38575 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Upk2P38575 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Upk2P38575 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Upk2P38575 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Upk2P38575 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Upk2P38575 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Upk2P38575 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Upk2P38575 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upk2P38575 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Upk2P38575 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upk2P38575 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upk2P38575 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upk2P38575 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upk2P38575 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upk2P38575 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upk2P38575 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upk2P38575 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upk2P38575 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upk2P38575 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upk2P38575 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upk2P38575 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upk2P38575 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upk2P38575 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upk2P38575 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upk2P38575 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upk2P38575 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Upk2P38575 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upk2P38575 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Upk2P38575 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Upk2P38575 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Upk2P38575 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upk2P38575 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upk2P38575 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upk2P38575 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upk2P38575 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upk2P38575 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upk2P38575 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Upk2P38575 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Upk2P38575 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Upk2P38575 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Upk2P38575 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Upk2P38575 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upk2P38575 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Upk2P38575 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upk2P38575 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upk2P38575 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upk2P38575 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upk2P38575 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upk2P38575 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Upk2P38575 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Upk2P38575 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Upk2P38575 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upk2P38575 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upk2P38575 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upk2P38575 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upk2P38575 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upk2P38575 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upk2P38575 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upk2P38575 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upk2P38575 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upk2P38575 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Upk2P38575 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upk2P38575 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Upk2P38575 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Upk2P38575 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Upk2P38575 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upk2P38575 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upk2P38575 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Upk2P38575 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Upk2P38575 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upk2P38575 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upk2P38575 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Upk2P38575 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Upk2P38575 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upk2P38575 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Upk2P38575 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Upk2P38575 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Upk2P38575 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Upk2P38575 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upk2P38575 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upk2P38575 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Upk2P38575 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Upk2P38575 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms