Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stfa1P35175 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stfa1P35175 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Stfa1P35175 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stfa1P35175 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stfa1P35175 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stfa1P35175 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Stfa1P35175 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stfa1P35175 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stfa1P35175 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Stfa1P35175 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Stfa1P35175 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Stfa1P35175 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Stfa1P35175 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Stfa1P35175 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Stfa1P35175 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stfa1P35175 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stfa1P35175 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Stfa1P35175 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Stfa1P35175 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Stfa1P35175 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stfa1P35175 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Stfa1P35175 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stfa1P35175 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Stfa1P35175 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stfa1P35175 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stfa1P35175 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Stfa1P35175 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Stfa1P35175 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stfa1P35175 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Stfa1P35175 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Stfa1P35175 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stfa1P35175 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stfa1P35175 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Stfa1P35175 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stfa1P35175 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Stfa1P35175 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stfa1P35175 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Stfa1P35175 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stfa1P35175 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stfa1P35175 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Stfa1P35175 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stfa1P35175 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stfa1P35175 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stfa1P35175 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stfa1P35175 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Stfa1P35175 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Stfa1P35175 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Stfa1P35175 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Stfa1P35175 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stfa1P35175 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Stfa1P35175 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stfa1P35175 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Stfa1P35175 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stfa1P35175 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stfa1P35175 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Stfa1P35175 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Stfa1P35175 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stfa1P35175 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Stfa1P35175 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stfa1P35175 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Stfa1P35175 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stfa1P35175 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stfa1P35175 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Stfa1P35175 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Stfa1P35175 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Stfa1P35175 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stfa1P35175 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stfa1P35175 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Stfa1P35175 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Stfa1P35175 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Stfa1P35175 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stfa1P35175 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stfa1P35175 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Stfa1P35175 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stfa1P35175 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stfa1P35175 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stfa1P35175 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stfa1P35175 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stfa1P35175 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stfa1P35175 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stfa1P35175 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stfa1P35175 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stfa1P35175 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stfa1P35175 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Stfa1P35175 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Stfa1P35175 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stfa1P35175 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stfa1P35175 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stfa1P35175 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stfa1P35175 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stfa1P35175 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stfa1P35175 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stfa1P35175 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Stfa1P35175 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stfa1P35175 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Stfa1P35175 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Stfa1P35175 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stfa1P35175 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Stfa1P35175 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms