Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gsx2P31316 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gsx2P31316 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gsx2P31316 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gsx2P31316 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gsx2P31316 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gsx2P31316 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gsx2P31316 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gsx2P31316 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gsx2P31316 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gsx2P31316 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gsx2P31316 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gsx2P31316 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gsx2P31316 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gsx2P31316 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gsx2P31316 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gsx2P31316 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gsx2P31316 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gsx2P31316 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gsx2P31316 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gsx2P31316 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gsx2P31316 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gsx2P31316 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gsx2P31316 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gsx2P31316 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gsx2P31316 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gsx2P31316 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gsx2P31316 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gsx2P31316 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gsx2P31316 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gsx2P31316 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gsx2P31316 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gsx2P31316 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gsx2P31316 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gsx2P31316 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gsx2P31316 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gsx2P31316 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gsx2P31316 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gsx2P31316 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gsx2P31316 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gsx2P31316 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gsx2P31316 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gsx2P31316 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gsx2P31316 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gsx2P31316 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gsx2P31316 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gsx2P31316 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gsx2P31316 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gsx2P31316 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gsx2P31316 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gsx2P31316 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gsx2P31316 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gsx2P31316 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gsx2P31316 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gsx2P31316 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gsx2P31316 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gsx2P31316 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gsx2P31316 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gsx2P31316 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gsx2P31316 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gsx2P31316 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gsx2P31316 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gsx2P31316 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gsx2P31316 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gsx2P31316 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gsx2P31316 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gsx2P31316 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gsx2P31316 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gsx2P31316 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gsx2P31316 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gsx2P31316 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gsx2P31316 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gsx2P31316 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gsx2P31316 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gsx2P31316 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gsx2P31316 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gsx2P31316 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gsx2P31316 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gsx2P31316 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gsx2P31316 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gsx2P31316 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gsx2P31316 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gsx2P31316 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gsx2P31316 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gsx2P31316 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gsx2P31316 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gsx2P31316 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gsx2P31316 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gsx2P31316 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gsx2P31316 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gsx2P31316 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gsx2P31316 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gsx2P31316 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gsx2P31316 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gsx2P31316 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gsx2P31316 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gsx2P31316 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gsx2P31316 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gsx2P31316 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gsx2P31316 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms