Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RxraP28700 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RxraP28700 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RxraP28700 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RxraP28700 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RxraP28700 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RxraP28700 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RxraP28700 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RxraP28700 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RxraP28700 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RxraP28700 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RxraP28700 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RxraP28700 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RxraP28700 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RxraP28700 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RxraP28700 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RxraP28700 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RxraP28700 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RxraP28700 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RxraP28700 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RxraP28700 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RxraP28700 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RxraP28700 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RxraP28700 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RxraP28700 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RxraP28700 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RxraP28700 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RxraP28700 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RxraP28700 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RxraP28700 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RxraP28700 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RxraP28700 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RxraP28700 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RxraP28700 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RxraP28700 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RxraP28700 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RxraP28700 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RxraP28700 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RxraP28700 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RxraP28700 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RxraP28700 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RxraP28700 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RxraP28700 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RxraP28700 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RxraP28700 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RxraP28700 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RxraP28700 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RxraP28700 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RxraP28700 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RxraP28700 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RxraP28700 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RxraP28700 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RxraP28700 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RxraP28700 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RxraP28700 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RxraP28700 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RxraP28700 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RxraP28700 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RxraP28700 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
RxraP28700 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RxraP28700 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RxraP28700 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RxraP28700 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RxraP28700 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RxraP28700 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RxraP28700 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RxraP28700 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RxraP28700 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RxraP28700 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RxraP28700 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RxraP28700 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RxraP28700 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RxraP28700 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RxraP28700 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RxraP28700 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RxraP28700 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RxraP28700 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RxraP28700 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RxraP28700 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RxraP28700 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RxraP28700 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RxraP28700 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RxraP28700 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RxraP28700 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RxraP28700 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RxraP28700 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RxraP28700 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RxraP28700 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RxraP28700 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RxraP28700 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RxraP28700 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RxraP28700 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RxraP28700 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RxraP28700 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RxraP28700 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RxraP28700 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RxraP28700 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RxraP28700 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RxraP28700 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RxraP28700 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms