Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa2P28309 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa2P28309 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa2P28309 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa2P28309 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa2P28309 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa2P28309 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa2P28309 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa2P28309 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa2P28309 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa2P28309 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Defa2P28309 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa2P28309 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Defa2P28309 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa2P28309 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Defa2P28309 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Defa2P28309 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa2P28309 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa2P28309 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa2P28309 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa2P28309 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa2P28309 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Defa2P28309 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa2P28309 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa2P28309 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa2P28309 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa2P28309 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa2P28309 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa2P28309 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Defa2P28309 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa2P28309 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defa2P28309 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa2P28309 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa2P28309 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa2P28309 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defa2P28309 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa2P28309 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defa2P28309 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa2P28309 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa2P28309 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa2P28309 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa2P28309 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa2P28309 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa2P28309 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa2P28309 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa2P28309 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa2P28309 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa2P28309 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa2P28309 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa2P28309 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa2P28309 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa2P28309 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa2P28309 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa2P28309 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa2P28309 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa2P28309 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa2P28309 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa2P28309 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa2P28309 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa2P28309 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa2P28309 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa2P28309 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa2P28309 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa2P28309 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa2P28309 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa2P28309 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa2P28309 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa2P28309 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa2P28309 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa2P28309 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa2P28309 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa2P28309 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa2P28309 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa2P28309 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa2P28309 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa2P28309 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa2P28309 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa2P28309 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa2P28309 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa2P28309 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa2P28309 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa2P28309 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa2P28309 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa2P28309 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa2P28309 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa2P28309 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa2P28309 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa2P28309 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa2P28309 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa2P28309 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa2P28309 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa2P28309 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa2P28309 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa2P28309 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa2P28309 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa2P28309 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa2P28309 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa2P28309 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa2P28309 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa2P28309 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms