Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
U2af2P26369 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
U2af2P26369 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
U2af2P26369 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
U2af2P26369 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
U2af2P26369 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
U2af2P26369 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
U2af2P26369 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
U2af2P26369 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
U2af2P26369 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
U2af2P26369 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
U2af2P26369 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
U2af2P26369 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30■■■□□ 2.39
U2af2P26369 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
U2af2P26369 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
U2af2P26369 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
U2af2P26369 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
U2af2P26369 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
U2af2P26369 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
U2af2P26369 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
U2af2P26369 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
U2af2P26369 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
U2af2P26369 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
U2af2P26369 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
U2af2P26369 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
U2af2P26369 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
U2af2P26369 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
U2af2P26369 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
U2af2P26369 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
U2af2P26369 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
U2af2P26369 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
U2af2P26369 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
U2af2P26369 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
U2af2P26369 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
U2af2P26369 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2af2P26369 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
U2af2P26369 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
U2af2P26369 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
U2af2P26369 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
U2af2P26369 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
U2af2P26369 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
U2af2P26369 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
U2af2P26369 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
U2af2P26369 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
U2af2P26369 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
U2af2P26369 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
U2af2P26369 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
U2af2P26369 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
U2af2P26369 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
U2af2P26369 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
U2af2P26369 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
U2af2P26369 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
U2af2P26369 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
U2af2P26369 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
U2af2P26369 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
U2af2P26369 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
U2af2P26369 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
U2af2P26369 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
U2af2P26369 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
U2af2P26369 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
U2af2P26369 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
U2af2P26369 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
U2af2P26369 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
U2af2P26369 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
U2af2P26369 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
U2af2P26369 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
U2af2P26369 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
U2af2P26369 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
U2af2P26369 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
U2af2P26369 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
U2af2P26369 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
U2af2P26369 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
U2af2P26369 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
U2af2P26369 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
U2af2P26369 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
U2af2P26369 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
U2af2P26369 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
U2af2P26369 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
U2af2P26369 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
U2af2P26369 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
U2af2P26369 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
U2af2P26369 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
U2af2P26369 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
U2af2P26369 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
U2af2P26369 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
U2af2P26369 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
U2af2P26369 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
U2af2P26369 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
U2af2P26369 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
U2af2P26369 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2af2P26369 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2af2P26369 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2af2P26369 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
U2af2P26369 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
U2af2P26369 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
U2af2P26369 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
U2af2P26369 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
U2af2P26369 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
U2af2P26369 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
U2af2P26369 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms