Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bmi1P25916 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bmi1P25916 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bmi1P25916 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bmi1P25916 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Bmi1P25916 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bmi1P25916 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bmi1P25916 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bmi1P25916 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bmi1P25916 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bmi1P25916 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bmi1P25916 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bmi1P25916 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bmi1P25916 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bmi1P25916 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bmi1P25916 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bmi1P25916 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bmi1P25916 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bmi1P25916 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bmi1P25916 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bmi1P25916 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Bmi1P25916 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bmi1P25916 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bmi1P25916 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bmi1P25916 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bmi1P25916 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bmi1P25916 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bmi1P25916 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bmi1P25916 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bmi1P25916 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bmi1P25916 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bmi1P25916 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Bmi1P25916 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bmi1P25916 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bmi1P25916 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bmi1P25916 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bmi1P25916 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bmi1P25916 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bmi1P25916 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bmi1P25916 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bmi1P25916 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bmi1P25916 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bmi1P25916 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bmi1P25916 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bmi1P25916 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bmi1P25916 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Bmi1P25916 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bmi1P25916 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Bmi1P25916 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bmi1P25916 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bmi1P25916 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bmi1P25916 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bmi1P25916 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bmi1P25916 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bmi1P25916 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bmi1P25916 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bmi1P25916 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bmi1P25916 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bmi1P25916 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bmi1P25916 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bmi1P25916 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bmi1P25916 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bmi1P25916 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bmi1P25916 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bmi1P25916 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bmi1P25916 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bmi1P25916 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bmi1P25916 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bmi1P25916 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bmi1P25916 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bmi1P25916 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bmi1P25916 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bmi1P25916 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Bmi1P25916 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bmi1P25916 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bmi1P25916 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Bmi1P25916 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bmi1P25916 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bmi1P25916 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bmi1P25916 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bmi1P25916 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bmi1P25916 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bmi1P25916 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bmi1P25916 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bmi1P25916 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Bmi1P25916 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bmi1P25916 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bmi1P25916 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bmi1P25916 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bmi1P25916 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bmi1P25916 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bmi1P25916 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bmi1P25916 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bmi1P25916 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bmi1P25916 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bmi1P25916 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bmi1P25916 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bmi1P25916 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bmi1P25916 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bmi1P25916 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms