Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
Cdk11bP24788 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Cdk11bP24788 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
Cdk11bP24788 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
Cdk11bP24788 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
Cdk11bP24788 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Cdk11bP24788 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Cdk11bP24788 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Cdk11bP24788 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Cdk11bP24788 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Cdk11bP24788 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Cdk11bP24788 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Cdk11bP24788 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Cdk11bP24788 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Cdk11bP24788 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Cdk11bP24788 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Cdk11bP24788 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC40.07■■■■■ 4.01
Cdk11bP24788 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
Cdk11bP24788 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Cdk11bP24788 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Cdk11bP24788 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC40.01■■■■■ 4
Cdk11bP24788 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Cdk11bP24788 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Cdk11bP24788 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Cdk11bP24788 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Cdk11bP24788 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Cdk11bP24788 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Cdk11bP24788 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Cdk11bP24788 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Cdk11bP24788 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Cdk11bP24788 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Cdk11bP24788 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Cdk11bP24788 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Cdk11bP24788 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Cdk11bP24788 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
Cdk11bP24788 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Cdk11bP24788 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Cdk11bP24788 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Cdk11bP24788 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
Cdk11bP24788 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
Cdk11bP24788 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Cdk11bP24788 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Cdk11bP24788 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Cdk11bP24788 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Cdk11bP24788 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Cdk11bP24788 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
Cdk11bP24788 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
Cdk11bP24788 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Cdk11bP24788 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Cdk11bP24788 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Cdk11bP24788 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
Cdk11bP24788 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Cdk11bP24788 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Cdk11bP24788 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
Cdk11bP24788 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Cdk11bP24788 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Cdk11bP24788 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Cdk11bP24788 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Cdk11bP24788 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
Cdk11bP24788 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Cdk11bP24788 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Cdk11bP24788 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Cdk11bP24788 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
Cdk11bP24788 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
Cdk11bP24788 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Cdk11bP24788 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Cdk11bP24788 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Cdk11bP24788 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Cdk11bP24788 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Cdk11bP24788 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
Cdk11bP24788 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Cdk11bP24788 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Cdk11bP24788 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Cdk11bP24788 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Cdk11bP24788 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Cdk11bP24788 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Cdk11bP24788 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Cdk11bP24788 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Cdk11bP24788 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Cdk11bP24788 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Cdk11bP24788 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Cdk11bP24788 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Cdk11bP24788 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Cdk11bP24788 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
Cdk11bP24788 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Cdk11bP24788 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Cdk11bP24788 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Cdk11bP24788 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Cdk11bP24788 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Cdk11bP24788 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Cdk11bP24788 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Cdk11bP24788 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Cdk11bP24788 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Cdk11bP24788 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Cdk11bP24788 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
Cdk11bP24788 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Cdk11bP24788 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Cdk11bP24788 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Cdk11bP24788 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Cdk11bP24788 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms