Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Htr3aP23979 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Htr3aP23979 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Htr3aP23979 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Htr3aP23979 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Htr3aP23979 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Htr3aP23979 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Htr3aP23979 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Htr3aP23979 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Htr3aP23979 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Htr3aP23979 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Htr3aP23979 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Htr3aP23979 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Htr3aP23979 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Htr3aP23979 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Htr3aP23979 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Htr3aP23979 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Htr3aP23979 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Htr3aP23979 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Htr3aP23979 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Htr3aP23979 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Htr3aP23979 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Htr3aP23979 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Htr3aP23979 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Htr3aP23979 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Htr3aP23979 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Htr3aP23979 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Htr3aP23979 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Htr3aP23979 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Htr3aP23979 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Htr3aP23979 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Htr3aP23979 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Htr3aP23979 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Htr3aP23979 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Htr3aP23979 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Htr3aP23979 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Htr3aP23979 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Htr3aP23979 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Htr3aP23979 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Htr3aP23979 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Htr3aP23979 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Htr3aP23979 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Htr3aP23979 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Htr3aP23979 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Htr3aP23979 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Htr3aP23979 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Htr3aP23979 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Htr3aP23979 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Htr3aP23979 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Htr3aP23979 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Htr3aP23979 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Htr3aP23979 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Htr3aP23979 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Htr3aP23979 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Htr3aP23979 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Htr3aP23979 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Htr3aP23979 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Htr3aP23979 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Htr3aP23979 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htr3aP23979 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Htr3aP23979 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Htr3aP23979 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Htr3aP23979 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Htr3aP23979 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Htr3aP23979 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Htr3aP23979 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Htr3aP23979 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Htr3aP23979 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Htr3aP23979 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Htr3aP23979 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Htr3aP23979 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Htr3aP23979 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Htr3aP23979 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Htr3aP23979 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Htr3aP23979 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Htr3aP23979 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Htr3aP23979 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Htr3aP23979 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Htr3aP23979 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Htr3aP23979 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Htr3aP23979 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Htr3aP23979 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Htr3aP23979 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Htr3aP23979 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Htr3aP23979 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Htr3aP23979 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Htr3aP23979 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Htr3aP23979 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Htr3aP23979 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htr3aP23979 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htr3aP23979 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htr3aP23979 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Htr3aP23979 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Htr3aP23979 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htr3aP23979 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Htr3aP23979 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htr3aP23979 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htr3aP23979 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htr3aP23979 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Htr3aP23979 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms