Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PrkchP23298 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PrkchP23298 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PrkchP23298 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PrkchP23298 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PrkchP23298 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PrkchP23298 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PrkchP23298 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PrkchP23298 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PrkchP23298 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PrkchP23298 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PrkchP23298 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PrkchP23298 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PrkchP23298 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PrkchP23298 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PrkchP23298 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PrkchP23298 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PrkchP23298 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PrkchP23298 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PrkchP23298 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PrkchP23298 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PrkchP23298 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PrkchP23298 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PrkchP23298 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PrkchP23298 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PrkchP23298 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PrkchP23298 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrkchP23298 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrkchP23298 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PrkchP23298 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PrkchP23298 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PrkchP23298 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PrkchP23298 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PrkchP23298 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PrkchP23298 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PrkchP23298 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PrkchP23298 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PrkchP23298 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PrkchP23298 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PrkchP23298 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrkchP23298 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrkchP23298 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PrkchP23298 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PrkchP23298 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PrkchP23298 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PrkchP23298 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PrkchP23298 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PrkchP23298 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PrkchP23298 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PrkchP23298 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrkchP23298 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrkchP23298 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PrkchP23298 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PrkchP23298 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PrkchP23298 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PrkchP23298 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PrkchP23298 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PrkchP23298 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PrkchP23298 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PrkchP23298 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PrkchP23298 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PrkchP23298 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PrkchP23298 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrkchP23298 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrkchP23298 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PrkchP23298 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PrkchP23298 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PrkchP23298 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PrkchP23298 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PrkchP23298 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PrkchP23298 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PrkchP23298 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrkchP23298 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrkchP23298 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrkchP23298 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrkchP23298 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrkchP23298 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PrkchP23298 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PrkchP23298 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PrkchP23298 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PrkchP23298 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PrkchP23298 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PrkchP23298 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PrkchP23298 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PrkchP23298 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrkchP23298 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrkchP23298 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrkchP23298 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PrkchP23298 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PrkchP23298 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PrkchP23298 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PrkchP23298 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrkchP23298 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PrkchP23298 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PrkchP23298 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PrkchP23298 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrkchP23298 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrkchP23298 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrkchP23298 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PrkchP23298 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms