Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP20293 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TP20293 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TP20293 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TP20293 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TP20293 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TP20293 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TP20293 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TP20293 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TP20293 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TP20293 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TP20293 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TP20293 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TP20293 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TP20293 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TP20293 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP20293 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP20293 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP20293 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP20293 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP20293 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TP20293 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP20293 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP20293 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP20293 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TP20293 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP20293 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP20293 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP20293 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP20293 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP20293 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP20293 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TP20293 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TP20293 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TP20293 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TP20293 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TP20293 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TP20293 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TP20293 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TP20293 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TP20293 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TP20293 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TP20293 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TP20293 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TP20293 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TP20293 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TP20293 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TP20293 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TP20293 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TP20293 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TP20293 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TP20293 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TP20293 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TP20293 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TP20293 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TP20293 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TP20293 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TP20293 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TP20293 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TP20293 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TP20293 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TP20293 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TP20293 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TP20293 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TP20293 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TP20293 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TP20293 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TP20293 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TP20293 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TP20293 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TP20293 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TP20293 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TP20293 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TP20293 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TP20293 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TP20293 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TP20293 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TP20293 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TP20293 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TP20293 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TP20293 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TP20293 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TP20293 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP20293 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP20293 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TP20293 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TP20293 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TP20293 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TP20293 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TP20293 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP20293 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP20293 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP20293 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP20293 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP20293 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP20293 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP20293 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP20293 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP20293 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TP20293 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.1 ms