Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Selenbp1P17563 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Selenbp1P17563 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Selenbp1P17563 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Selenbp1P17563 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Selenbp1P17563 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Selenbp1P17563 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Selenbp1P17563 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Selenbp1P17563 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Selenbp1P17563 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Selenbp1P17563 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Selenbp1P17563 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Selenbp1P17563 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Selenbp1P17563 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Selenbp1P17563 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Selenbp1P17563 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Selenbp1P17563 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Selenbp1P17563 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Selenbp1P17563 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Selenbp1P17563 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Selenbp1P17563 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Selenbp1P17563 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Selenbp1P17563 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Selenbp1P17563 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Selenbp1P17563 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Selenbp1P17563 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Selenbp1P17563 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Selenbp1P17563 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Selenbp1P17563 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Selenbp1P17563 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Selenbp1P17563 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Selenbp1P17563 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Selenbp1P17563 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Selenbp1P17563 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Selenbp1P17563 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Selenbp1P17563 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Selenbp1P17563 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Selenbp1P17563 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Selenbp1P17563 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Selenbp1P17563 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Selenbp1P17563 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Selenbp1P17563 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Selenbp1P17563 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Selenbp1P17563 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Selenbp1P17563 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Selenbp1P17563 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Selenbp1P17563 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Selenbp1P17563 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Selenbp1P17563 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Selenbp1P17563 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Selenbp1P17563 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Selenbp1P17563 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Selenbp1P17563 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Selenbp1P17563 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Selenbp1P17563 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Selenbp1P17563 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Selenbp1P17563 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Selenbp1P17563 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Selenbp1P17563 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Selenbp1P17563 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Selenbp1P17563 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Selenbp1P17563 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Selenbp1P17563 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Selenbp1P17563 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Selenbp1P17563 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Selenbp1P17563 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Selenbp1P17563 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Selenbp1P17563 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Selenbp1P17563 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Selenbp1P17563 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Selenbp1P17563 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Selenbp1P17563 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Selenbp1P17563 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Selenbp1P17563 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Selenbp1P17563 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Selenbp1P17563 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Selenbp1P17563 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Selenbp1P17563 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Selenbp1P17563 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Selenbp1P17563 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Selenbp1P17563 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Selenbp1P17563 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Selenbp1P17563 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Selenbp1P17563 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Selenbp1P17563 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Selenbp1P17563 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Selenbp1P17563 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Selenbp1P17563 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Selenbp1P17563 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Selenbp1P17563 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Selenbp1P17563 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Selenbp1P17563 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Selenbp1P17563 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Selenbp1P17563 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Selenbp1P17563 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Selenbp1P17563 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Selenbp1P17563 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Selenbp1P17563 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Selenbp1P17563 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Selenbp1P17563 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms