Protein–RNA interactions for Protein: P16858

Gapdh, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GapdhP16858 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GapdhP16858 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GapdhP16858 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GapdhP16858 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GapdhP16858 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GapdhP16858 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GapdhP16858 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GapdhP16858 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GapdhP16858 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GapdhP16858 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GapdhP16858 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GapdhP16858 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GapdhP16858 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GapdhP16858 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GapdhP16858 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GapdhP16858 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GapdhP16858 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GapdhP16858 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GapdhP16858 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GapdhP16858 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GapdhP16858 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GapdhP16858 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GapdhP16858 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GapdhP16858 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GapdhP16858 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GapdhP16858 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GapdhP16858 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GapdhP16858 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GapdhP16858 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GapdhP16858 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GapdhP16858 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GapdhP16858 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GapdhP16858 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GapdhP16858 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GapdhP16858 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GapdhP16858 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GapdhP16858 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GapdhP16858 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GapdhP16858 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GapdhP16858 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GapdhP16858 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GapdhP16858 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GapdhP16858 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GapdhP16858 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GapdhP16858 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GapdhP16858 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GapdhP16858 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GapdhP16858 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GapdhP16858 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GapdhP16858 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GapdhP16858 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GapdhP16858 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GapdhP16858 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GapdhP16858 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GapdhP16858 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GapdhP16858 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GapdhP16858 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GapdhP16858 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GapdhP16858 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GapdhP16858 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GapdhP16858 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GapdhP16858 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GapdhP16858 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GapdhP16858 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GapdhP16858 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GapdhP16858 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GapdhP16858 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GapdhP16858 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GapdhP16858 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GapdhP16858 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GapdhP16858 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GapdhP16858 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GapdhP16858 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GapdhP16858 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GapdhP16858 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GapdhP16858 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GapdhP16858 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GapdhP16858 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GapdhP16858 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GapdhP16858 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GapdhP16858 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GapdhP16858 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GapdhP16858 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GapdhP16858 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GapdhP16858 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GapdhP16858 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GapdhP16858 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GapdhP16858 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GapdhP16858 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GapdhP16858 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GapdhP16858 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GapdhP16858 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GapdhP16858 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GapdhP16858 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GapdhP16858 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GapdhP16858 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GapdhP16858 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GapdhP16858 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GapdhP16858 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GapdhP16858 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms