Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gabra6P16305 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gabra6P16305 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gabra6P16305 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Gabra6P16305 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabra6P16305 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabra6P16305 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gabra6P16305 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gabra6P16305 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabra6P16305 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gabra6P16305 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabra6P16305 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabra6P16305 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabra6P16305 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabra6P16305 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabra6P16305 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabra6P16305 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gabra6P16305 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gabra6P16305 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabra6P16305 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabra6P16305 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabra6P16305 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gabra6P16305 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gabra6P16305 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabra6P16305 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gabra6P16305 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabra6P16305 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gabra6P16305 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gabra6P16305 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabra6P16305 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gabra6P16305 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabra6P16305 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabra6P16305 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gabra6P16305 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabra6P16305 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gabra6P16305 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabra6P16305 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gabra6P16305 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabra6P16305 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gabra6P16305 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabra6P16305 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabra6P16305 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabra6P16305 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gabra6P16305 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gabra6P16305 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabra6P16305 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gabra6P16305 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gabra6P16305 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gabra6P16305 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabra6P16305 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabra6P16305 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gabra6P16305 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gabra6P16305 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gabra6P16305 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gabra6P16305 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabra6P16305 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabra6P16305 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gabra6P16305 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra6P16305 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra6P16305 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gabra6P16305 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gabra6P16305 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gabra6P16305 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabra6P16305 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gabra6P16305 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gabra6P16305 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gabra6P16305 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabra6P16305 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gabra6P16305 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gabra6P16305 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gabra6P16305 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabra6P16305 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabra6P16305 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabra6P16305 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gabra6P16305 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gabra6P16305 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gabra6P16305 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabra6P16305 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabra6P16305 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gabra6P16305 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabra6P16305 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabra6P16305 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gabra6P16305 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabra6P16305 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabra6P16305 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gabra6P16305 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gabra6P16305 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabra6P16305 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabra6P16305 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gabra6P16305 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabra6P16305 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabra6P16305 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabra6P16305 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gabra6P16305 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabra6P16305 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gabra6P16305 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gabra6P16305 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gabra6P16305 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabra6P16305 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gabra6P16305 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1115.1 ms