Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vpreb2P13373 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vpreb2P13373 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vpreb2P13373 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vpreb2P13373 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vpreb2P13373 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vpreb2P13373 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vpreb2P13373 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vpreb2P13373 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vpreb2P13373 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vpreb2P13373 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vpreb2P13373 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vpreb2P13373 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vpreb2P13373 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vpreb2P13373 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vpreb2P13373 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vpreb2P13373 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vpreb2P13373 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vpreb2P13373 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vpreb2P13373 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vpreb2P13373 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vpreb2P13373 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vpreb2P13373 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vpreb2P13373 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vpreb2P13373 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vpreb2P13373 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vpreb2P13373 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vpreb2P13373 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vpreb2P13373 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vpreb2P13373 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vpreb2P13373 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vpreb2P13373 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vpreb2P13373 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vpreb2P13373 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vpreb2P13373 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vpreb2P13373 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vpreb2P13373 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vpreb2P13373 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vpreb2P13373 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vpreb2P13373 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vpreb2P13373 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vpreb2P13373 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vpreb2P13373 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vpreb2P13373 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vpreb2P13373 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vpreb2P13373 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vpreb2P13373 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vpreb2P13373 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vpreb2P13373 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vpreb2P13373 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vpreb2P13373 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vpreb2P13373 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vpreb2P13373 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vpreb2P13373 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vpreb2P13373 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vpreb2P13373 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vpreb2P13373 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vpreb2P13373 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vpreb2P13373 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vpreb2P13373 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vpreb2P13373 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vpreb2P13373 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vpreb2P13373 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Vpreb2P13373 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vpreb2P13373 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vpreb2P13373 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vpreb2P13373 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vpreb2P13373 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vpreb2P13373 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vpreb2P13373 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vpreb2P13373 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vpreb2P13373 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vpreb2P13373 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vpreb2P13373 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vpreb2P13373 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vpreb2P13373 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vpreb2P13373 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vpreb2P13373 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vpreb2P13373 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vpreb2P13373 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vpreb2P13373 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vpreb2P13373 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vpreb2P13373 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vpreb2P13373 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vpreb2P13373 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vpreb2P13373 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vpreb2P13373 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vpreb2P13373 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vpreb2P13373 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vpreb2P13373 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vpreb2P13373 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vpreb2P13373 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vpreb2P13373 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vpreb2P13373 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vpreb2P13373 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vpreb2P13373 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vpreb2P13373 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vpreb2P13373 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vpreb2P13373 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vpreb2P13373 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms