Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vpreb1P13372 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vpreb1P13372 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vpreb1P13372 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vpreb1P13372 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vpreb1P13372 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vpreb1P13372 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vpreb1P13372 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vpreb1P13372 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vpreb1P13372 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vpreb1P13372 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vpreb1P13372 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vpreb1P13372 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vpreb1P13372 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vpreb1P13372 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vpreb1P13372 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vpreb1P13372 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vpreb1P13372 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vpreb1P13372 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vpreb1P13372 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vpreb1P13372 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vpreb1P13372 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vpreb1P13372 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vpreb1P13372 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vpreb1P13372 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vpreb1P13372 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vpreb1P13372 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vpreb1P13372 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vpreb1P13372 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vpreb1P13372 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vpreb1P13372 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vpreb1P13372 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vpreb1P13372 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vpreb1P13372 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vpreb1P13372 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vpreb1P13372 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vpreb1P13372 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vpreb1P13372 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vpreb1P13372 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vpreb1P13372 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vpreb1P13372 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vpreb1P13372 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vpreb1P13372 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vpreb1P13372 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vpreb1P13372 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vpreb1P13372 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vpreb1P13372 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vpreb1P13372 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vpreb1P13372 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vpreb1P13372 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vpreb1P13372 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vpreb1P13372 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vpreb1P13372 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vpreb1P13372 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vpreb1P13372 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vpreb1P13372 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vpreb1P13372 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vpreb1P13372 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vpreb1P13372 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vpreb1P13372 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vpreb1P13372 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vpreb1P13372 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vpreb1P13372 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vpreb1P13372 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vpreb1P13372 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vpreb1P13372 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vpreb1P13372 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vpreb1P13372 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vpreb1P13372 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vpreb1P13372 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vpreb1P13372 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vpreb1P13372 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vpreb1P13372 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vpreb1P13372 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vpreb1P13372 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vpreb1P13372 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vpreb1P13372 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vpreb1P13372 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vpreb1P13372 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vpreb1P13372 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vpreb1P13372 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vpreb1P13372 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vpreb1P13372 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vpreb1P13372 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vpreb1P13372 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vpreb1P13372 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vpreb1P13372 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vpreb1P13372 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vpreb1P13372 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vpreb1P13372 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vpreb1P13372 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vpreb1P13372 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vpreb1P13372 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vpreb1P13372 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vpreb1P13372 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vpreb1P13372 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vpreb1P13372 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vpreb1P13372 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vpreb1P13372 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vpreb1P13372 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms