Protein–RNA interactions for Protein: P13297

Msx1, Homeobox protein MSX-1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1P13297 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Msx1P13297 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Msx1P13297 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Msx1P13297 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msx1P13297 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Msx1P13297 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Msx1P13297 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Msx1P13297 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Msx1P13297 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Msx1P13297 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Msx1P13297 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Msx1P13297 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Msx1P13297 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Msx1P13297 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Msx1P13297 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msx1P13297 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Msx1P13297 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Msx1P13297 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Msx1P13297 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msx1P13297 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msx1P13297 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msx1P13297 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msx1P13297 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Msx1P13297 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Msx1P13297 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Msx1P13297 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Msx1P13297 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Msx1P13297 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msx1P13297 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msx1P13297 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Msx1P13297 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Msx1P13297 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Msx1P13297 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Msx1P13297 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Msx1P13297 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msx1P13297 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msx1P13297 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msx1P13297 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Msx1P13297 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Msx1P13297 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Msx1P13297 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Msx1P13297 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Msx1P13297 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Msx1P13297 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Msx1P13297 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Msx1P13297 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Msx1P13297 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Msx1P13297 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Msx1P13297 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Msx1P13297 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msx1P13297 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msx1P13297 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Msx1P13297 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Msx1P13297 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Msx1P13297 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Msx1P13297 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Msx1P13297 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Msx1P13297 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Msx1P13297 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Msx1P13297 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Msx1P13297 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Msx1P13297 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msx1P13297 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msx1P13297 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msx1P13297 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msx1P13297 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msx1P13297 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msx1P13297 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Msx1P13297 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msx1P13297 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msx1P13297 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msx1P13297 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msx1P13297 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msx1P13297 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Msx1P13297 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msx1P13297 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msx1P13297 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msx1P13297 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msx1P13297 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msx1P13297 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msx1P13297 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msx1P13297 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Msx1P13297 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Msx1P13297 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Msx1P13297 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msx1P13297 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msx1P13297 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Msx1P13297 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msx1P13297 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Msx1P13297 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Msx1P13297 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msx1P13297 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Msx1P13297 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msx1P13297 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Msx1P13297 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Msx1P13297 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Msx1P13297 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msx1P13297 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msx1P13297 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Msx1P13297 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms