Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chrm1P12657 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chrm1P12657 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Chrm1P12657 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Chrm1P12657 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Chrm1P12657 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chrm1P12657 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chrm1P12657 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chrm1P12657 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Chrm1P12657 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chrm1P12657 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Chrm1P12657 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chrm1P12657 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chrm1P12657 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chrm1P12657 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chrm1P12657 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chrm1P12657 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Chrm1P12657 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Chrm1P12657 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chrm1P12657 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Chrm1P12657 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chrm1P12657 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chrm1P12657 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chrm1P12657 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Chrm1P12657 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chrm1P12657 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chrm1P12657 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Chrm1P12657 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Chrm1P12657 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chrm1P12657 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Chrm1P12657 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Chrm1P12657 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Chrm1P12657 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Chrm1P12657 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Chrm1P12657 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chrm1P12657 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chrm1P12657 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chrm1P12657 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Chrm1P12657 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Chrm1P12657 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Chrm1P12657 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chrm1P12657 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chrm1P12657 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Chrm1P12657 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chrm1P12657 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Chrm1P12657 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Chrm1P12657 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chrm1P12657 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Chrm1P12657 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Chrm1P12657 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Chrm1P12657 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Chrm1P12657 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chrm1P12657 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chrm1P12657 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Chrm1P12657 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Chrm1P12657 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Chrm1P12657 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Chrm1P12657 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chrm1P12657 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chrm1P12657 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chrm1P12657 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Chrm1P12657 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chrm1P12657 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chrm1P12657 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chrm1P12657 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chrm1P12657 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chrm1P12657 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chrm1P12657 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chrm1P12657 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chrm1P12657 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chrm1P12657 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chrm1P12657 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chrm1P12657 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chrm1P12657 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chrm1P12657 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chrm1P12657 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chrm1P12657 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chrm1P12657 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chrm1P12657 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chrm1P12657 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chrm1P12657 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Chrm1P12657 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chrm1P12657 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chrm1P12657 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Chrm1P12657 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chrm1P12657 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chrm1P12657 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chrm1P12657 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chrm1P12657 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chrm1P12657 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chrm1P12657 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chrm1P12657 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chrm1P12657 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chrm1P12657 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chrm1P12657 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chrm1P12657 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Chrm1P12657 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Chrm1P12657 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chrm1P12657 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chrm1P12657 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms