Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxb4P10284 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxb4P10284 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxb4P10284 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxb4P10284 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Hoxb4P10284 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb4P10284 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hoxb4P10284 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hoxb4P10284 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxb4P10284 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hoxb4P10284 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxb4P10284 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxb4P10284 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxb4P10284 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxb4P10284 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxb4P10284 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxb4P10284 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxb4P10284 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxb4P10284 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxb4P10284 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxb4P10284 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxb4P10284 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxb4P10284 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxb4P10284 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxb4P10284 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxb4P10284 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxb4P10284 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxb4P10284 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb4P10284 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb4P10284 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb4P10284 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb4P10284 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxb4P10284 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxb4P10284 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxb4P10284 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxb4P10284 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxb4P10284 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxb4P10284 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxb4P10284 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxb4P10284 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxb4P10284 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb4P10284 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb4P10284 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb4P10284 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb4P10284 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb4P10284 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxb4P10284 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxb4P10284 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb4P10284 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb4P10284 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxb4P10284 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxb4P10284 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxb4P10284 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxb4P10284 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb4P10284 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxb4P10284 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxb4P10284 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxb4P10284 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxb4P10284 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxb4P10284 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxb4P10284 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxb4P10284 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxb4P10284 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxb4P10284 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hoxb4P10284 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxb4P10284 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxb4P10284 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxb4P10284 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxb4P10284 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxb4P10284 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxb4P10284 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxb4P10284 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxb4P10284 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxb4P10284 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxb4P10284 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxb4P10284 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxb4P10284 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxb4P10284 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxb4P10284 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxb4P10284 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxb4P10284 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxb4P10284 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxb4P10284 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxb4P10284 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxb4P10284 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hoxb4P10284 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxb4P10284 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxb4P10284 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxb4P10284 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxb4P10284 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxb4P10284 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxb4P10284 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxb4P10284 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxb4P10284 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb4P10284 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb4P10284 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb4P10284 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb4P10284 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb4P10284 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxb4P10284 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms