Protein–RNA interactions for Protein: P0C192

Lrrc4b, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4bP0C192 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrrc4bP0C192 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lrrc4bP0C192 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrrc4bP0C192 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc4bP0C192 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrrc4bP0C192 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lrrc4bP0C192 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrc4bP0C192 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lrrc4bP0C192 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrrc4bP0C192 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrrc4bP0C192 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lrrc4bP0C192 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrrc4bP0C192 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrrc4bP0C192 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc4bP0C192 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lrrc4bP0C192 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrrc4bP0C192 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrrc4bP0C192 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrrc4bP0C192 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrc4bP0C192 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrc4bP0C192 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrc4bP0C192 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrrc4bP0C192 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc4bP0C192 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc4bP0C192 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc4bP0C192 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc4bP0C192 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrc4bP0C192 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrc4bP0C192 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrrc4bP0C192 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lrrc4bP0C192 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrrc4bP0C192 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrrc4bP0C192 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrc4bP0C192 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrc4bP0C192 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrrc4bP0C192 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrrc4bP0C192 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrrc4bP0C192 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrrc4bP0C192 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc4bP0C192 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc4bP0C192 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc4bP0C192 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrrc4bP0C192 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrrc4bP0C192 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrrc4bP0C192 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrrc4bP0C192 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc4bP0C192 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc4bP0C192 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrrc4bP0C192 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrrc4bP0C192 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrrc4bP0C192 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrc4bP0C192 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lrrc4bP0C192 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lrrc4bP0C192 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lrrc4bP0C192 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrrc4bP0C192 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrrc4bP0C192 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrrc4bP0C192 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lrrc4bP0C192 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc4bP0C192 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc4bP0C192 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lrrc4bP0C192 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrc4bP0C192 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lrrc4bP0C192 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Lrrc4bP0C192 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrrc4bP0C192 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lrrc4bP0C192 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lrrc4bP0C192 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrrc4bP0C192 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrrc4bP0C192 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrrc4bP0C192 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lrrc4bP0C192 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lrrc4bP0C192 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrrc4bP0C192 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lrrc4bP0C192 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Lrrc4bP0C192 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrrc4bP0C192 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrrc4bP0C192 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lrrc4bP0C192 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lrrc4bP0C192 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrrc4bP0C192 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lrrc4bP0C192 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lrrc4bP0C192 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lrrc4bP0C192 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lrrc4bP0C192 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lrrc4bP0C192 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lrrc4bP0C192 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc4bP0C192 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc4bP0C192 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lrrc4bP0C192 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lrrc4bP0C192 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lrrc4bP0C192 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lrrc4bP0C192 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrc4bP0C192 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lrrc4bP0C192 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lrrc4bP0C192 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lrrc4bP0C192 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrrc4bP0C192 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrrc4bP0C192 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lrrc4bP0C192 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms