Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifna9P09235 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ifna9P09235 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ifna9P09235 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ifna9P09235 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifna9P09235 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ifna9P09235 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ifna9P09235 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ifna9P09235 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ifna9P09235 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifna9P09235 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifna9P09235 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ifna9P09235 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifna9P09235 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifna9P09235 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifna9P09235 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ifna9P09235 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifna9P09235 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifna9P09235 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifna9P09235 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifna9P09235 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifna9P09235 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifna9P09235 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifna9P09235 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifna9P09235 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifna9P09235 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifna9P09235 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifna9P09235 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifna9P09235 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifna9P09235 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ifna9P09235 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifna9P09235 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ifna9P09235 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifna9P09235 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifna9P09235 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ifna9P09235 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifna9P09235 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifna9P09235 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifna9P09235 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifna9P09235 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifna9P09235 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifna9P09235 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifna9P09235 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ifna9P09235 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifna9P09235 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ifna9P09235 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifna9P09235 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ifna9P09235 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifna9P09235 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifna9P09235 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifna9P09235 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifna9P09235 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifna9P09235 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifna9P09235 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifna9P09235 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifna9P09235 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ifna9P09235 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ifna9P09235 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifna9P09235 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifna9P09235 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifna9P09235 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ifna9P09235 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifna9P09235 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifna9P09235 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifna9P09235 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifna9P09235 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifna9P09235 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifna9P09235 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ifna9P09235 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ifna9P09235 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifna9P09235 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifna9P09235 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifna9P09235 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifna9P09235 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifna9P09235 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifna9P09235 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifna9P09235 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifna9P09235 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifna9P09235 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifna9P09235 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifna9P09235 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ifna9P09235 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifna9P09235 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifna9P09235 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifna9P09235 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifna9P09235 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifna9P09235 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifna9P09235 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifna9P09235 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifna9P09235 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifna9P09235 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifna9P09235 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifna9P09235 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifna9P09235 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifna9P09235 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifna9P09235 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifna9P09235 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifna9P09235 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifna9P09235 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifna9P09235 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms