Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxb3P09026 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxb3P09026 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxb3P09026 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxb3P09026 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxb3P09026 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxb3P09026 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxb3P09026 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxb3P09026 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxb3P09026 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxb3P09026 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxb3P09026 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxb3P09026 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxb3P09026 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxb3P09026 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxb3P09026 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxb3P09026 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxb3P09026 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxb3P09026 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxb3P09026 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxb3P09026 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxb3P09026 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxb3P09026 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxb3P09026 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxb3P09026 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxb3P09026 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxb3P09026 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxb3P09026 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxb3P09026 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxb3P09026 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxb3P09026 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxb3P09026 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxb3P09026 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxb3P09026 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxb3P09026 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxb3P09026 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxb3P09026 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxb3P09026 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxb3P09026 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxb3P09026 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxb3P09026 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxb3P09026 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxb3P09026 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxb3P09026 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxb3P09026 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxb3P09026 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxb3P09026 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxb3P09026 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxb3P09026 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxb3P09026 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxb3P09026 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxb3P09026 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxb3P09026 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxb3P09026 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxb3P09026 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxb3P09026 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxb3P09026 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxb3P09026 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxb3P09026 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxb3P09026 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxb3P09026 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxb3P09026 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxb3P09026 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hoxb3P09026 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxb3P09026 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxb3P09026 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hoxb3P09026 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hoxb3P09026 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hoxb3P09026 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxb3P09026 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxb3P09026 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxb3P09026 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxb3P09026 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hoxb3P09026 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hoxb3P09026 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hoxb3P09026 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hoxb3P09026 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hoxb3P09026 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hoxb3P09026 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hoxb3P09026 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Hoxb3P09026 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxb3P09026 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxb3P09026 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hoxb3P09026 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxb3P09026 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hoxb3P09026 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hoxb3P09026 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Hoxb3P09026 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxb3P09026 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxb3P09026 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hoxb3P09026 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hoxb3P09026 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hoxb3P09026 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Hoxb3P09026 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hoxb3P09026 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hoxb3P09026 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hoxb3P09026 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hoxb3P09026 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hoxb3P09026 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxb3P09026 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms