Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
NefmP08553 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
NefmP08553 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
NefmP08553 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
NefmP08553 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
NefmP08553 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
NefmP08553 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
NefmP08553 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
NefmP08553 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NefmP08553 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
NefmP08553 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
NefmP08553 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NefmP08553 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
NefmP08553 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
NefmP08553 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
NefmP08553 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
NefmP08553 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
NefmP08553 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
NefmP08553 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NefmP08553 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
NefmP08553 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NefmP08553 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NefmP08553 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NefmP08553 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
NefmP08553 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NefmP08553 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
NefmP08553 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NefmP08553 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NefmP08553 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NefmP08553 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NefmP08553 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
NefmP08553 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NefmP08553 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NefmP08553 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NefmP08553 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
NefmP08553 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NefmP08553 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NefmP08553 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NefmP08553 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NefmP08553 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NefmP08553 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
NefmP08553 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NefmP08553 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NefmP08553 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
NefmP08553 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
NefmP08553 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NefmP08553 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NefmP08553 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NefmP08553 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NefmP08553 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NefmP08553 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
NefmP08553 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
NefmP08553 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NefmP08553 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NefmP08553 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NefmP08553 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NefmP08553 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NefmP08553 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
NefmP08553 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NefmP08553 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NefmP08553 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
NefmP08553 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NefmP08553 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NefmP08553 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NefmP08553 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NefmP08553 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NefmP08553 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
NefmP08553 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NefmP08553 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
NefmP08553 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NefmP08553 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NefmP08553 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NefmP08553 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NefmP08553 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NefmP08553 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NefmP08553 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NefmP08553 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
NefmP08553 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NefmP08553 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NefmP08553 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NefmP08553 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NefmP08553 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NefmP08553 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
NefmP08553 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NefmP08553 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NefmP08553 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NefmP08553 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NefmP08553 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NefmP08553 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
NefmP08553 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NefmP08553 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NefmP08553 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NefmP08553 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NefmP08553 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
NefmP08553 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NefmP08553 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
NefmP08553 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NefmP08553 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NefmP08553 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NefmP08553 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms