Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SparcP07214 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SparcP07214 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SparcP07214 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SparcP07214 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SparcP07214 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SparcP07214 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SparcP07214 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SparcP07214 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SparcP07214 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SparcP07214 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SparcP07214 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SparcP07214 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SparcP07214 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SparcP07214 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SparcP07214 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SparcP07214 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SparcP07214 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SparcP07214 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SparcP07214 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SparcP07214 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SparcP07214 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SparcP07214 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SparcP07214 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SparcP07214 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SparcP07214 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SparcP07214 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SparcP07214 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SparcP07214 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SparcP07214 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SparcP07214 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SparcP07214 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SparcP07214 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SparcP07214 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SparcP07214 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SparcP07214 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SparcP07214 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SparcP07214 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SparcP07214 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SparcP07214 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SparcP07214 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SparcP07214 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SparcP07214 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SparcP07214 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SparcP07214 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SparcP07214 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SparcP07214 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SparcP07214 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SparcP07214 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SparcP07214 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SparcP07214 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SparcP07214 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SparcP07214 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SparcP07214 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SparcP07214 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SparcP07214 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SparcP07214 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SparcP07214 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SparcP07214 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SparcP07214 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SparcP07214 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SparcP07214 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SparcP07214 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SparcP07214 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SparcP07214 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SparcP07214 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SparcP07214 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SparcP07214 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SparcP07214 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SparcP07214 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SparcP07214 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SparcP07214 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SparcP07214 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SparcP07214 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SparcP07214 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SparcP07214 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SparcP07214 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SparcP07214 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SparcP07214 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SparcP07214 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SparcP07214 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SparcP07214 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SparcP07214 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SparcP07214 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SparcP07214 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SparcP07214 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SparcP07214 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SparcP07214 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SparcP07214 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SparcP07214 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SparcP07214 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SparcP07214 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SparcP07214 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SparcP07214 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SparcP07214 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SparcP07214 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SparcP07214 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SparcP07214 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SparcP07214 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SparcP07214 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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