Protein–RNA interactions for Protein: P06880

Gh1, Somatotropin, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gh1P06880 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Gh1P06880 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gh1P06880 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gh1P06880 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gh1P06880 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gh1P06880 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gh1P06880 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gh1P06880 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gh1P06880 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gh1P06880 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gh1P06880 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gh1P06880 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gh1P06880 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gh1P06880 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gh1P06880 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gh1P06880 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gh1P06880 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gh1P06880 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gh1P06880 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gh1P06880 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gh1P06880 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gh1P06880 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gh1P06880 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gh1P06880 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gh1P06880 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gh1P06880 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gh1P06880 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gh1P06880 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gh1P06880 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gh1P06880 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gh1P06880 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gh1P06880 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gh1P06880 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gh1P06880 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gh1P06880 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gh1P06880 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gh1P06880 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gh1P06880 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gh1P06880 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gh1P06880 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gh1P06880 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gh1P06880 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gh1P06880 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gh1P06880 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gh1P06880 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gh1P06880 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gh1P06880 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gh1P06880 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gh1P06880 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gh1P06880 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gh1P06880 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gh1P06880 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gh1P06880 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gh1P06880 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gh1P06880 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gh1P06880 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gh1P06880 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gh1P06880 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gh1P06880 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gh1P06880 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gh1P06880 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gh1P06880 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gh1P06880 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gh1P06880 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gh1P06880 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gh1P06880 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gh1P06880 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gh1P06880 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gh1P06880 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gh1P06880 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gh1P06880 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gh1P06880 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gh1P06880 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gh1P06880 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gh1P06880 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gh1P06880 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gh1P06880 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gh1P06880 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gh1P06880 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gh1P06880 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gh1P06880 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gh1P06880 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gh1P06880 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gh1P06880 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gh1P06880 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gh1P06880 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gh1P06880 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gh1P06880 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gh1P06880 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gh1P06880 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gh1P06880 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gh1P06880 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gh1P06880 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gh1P06880 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gh1P06880 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gh1P06880 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gh1P06880 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gh1P06880 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gh1P06880 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gh1P06880 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms