Protein–RNA interactions for Protein: P06879

Prl, Prolactin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrlP06879 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PrlP06879 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PrlP06879 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PrlP06879 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PrlP06879 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PrlP06879 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PrlP06879 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PrlP06879 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PrlP06879 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PrlP06879 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PrlP06879 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PrlP06879 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PrlP06879 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PrlP06879 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PrlP06879 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrlP06879 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrlP06879 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PrlP06879 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PrlP06879 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PrlP06879 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PrlP06879 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PrlP06879 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PrlP06879 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PrlP06879 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PrlP06879 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrlP06879 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PrlP06879 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PrlP06879 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrlP06879 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrlP06879 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrlP06879 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PrlP06879 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrlP06879 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PrlP06879 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PrlP06879 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PrlP06879 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PrlP06879 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PrlP06879 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PrlP06879 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PrlP06879 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrlP06879 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrlP06879 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrlP06879 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PrlP06879 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PrlP06879 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PrlP06879 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PrlP06879 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PrlP06879 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PrlP06879 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PrlP06879 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PrlP06879 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PrlP06879 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PrlP06879 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PrlP06879 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrlP06879 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrlP06879 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PrlP06879 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PrlP06879 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PrlP06879 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PrlP06879 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PrlP06879 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PrlP06879 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PrlP06879 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PrlP06879 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PrlP06879 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PrlP06879 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PrlP06879 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrlP06879 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PrlP06879 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrlP06879 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PrlP06879 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PrlP06879 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PrlP06879 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PrlP06879 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrlP06879 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PrlP06879 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PrlP06879 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PrlP06879 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PrlP06879 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PrlP06879 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PrlP06879 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PrlP06879 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PrlP06879 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PrlP06879 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PrlP06879 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PrlP06879 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PrlP06879 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PrlP06879 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PrlP06879 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrlP06879 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrlP06879 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrlP06879 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PrlP06879 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PrlP06879 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PrlP06879 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrlP06879 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrlP06879 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PrlP06879 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PrlP06879 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PrlP06879 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.5 ms