Protein–RNA interactions for Protein: P06876

Myb, Transcriptional activator Myb, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MybP06876 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MybP06876 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MybP06876 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MybP06876 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MybP06876 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
MybP06876 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MybP06876 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MybP06876 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MybP06876 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MybP06876 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MybP06876 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MybP06876 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
MybP06876 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MybP06876 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
MybP06876 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MybP06876 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MybP06876 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MybP06876 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MybP06876 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MybP06876 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MybP06876 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MybP06876 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MybP06876 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MybP06876 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MybP06876 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MybP06876 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MybP06876 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MybP06876 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MybP06876 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MybP06876 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MybP06876 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MybP06876 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MybP06876 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MybP06876 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MybP06876 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MybP06876 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MybP06876 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MybP06876 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MybP06876 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MybP06876 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MybP06876 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MybP06876 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MybP06876 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MybP06876 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MybP06876 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MybP06876 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MybP06876 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MybP06876 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MybP06876 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MybP06876 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MybP06876 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MybP06876 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MybP06876 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MybP06876 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MybP06876 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MybP06876 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MybP06876 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MybP06876 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MybP06876 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MybP06876 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MybP06876 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MybP06876 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MybP06876 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MybP06876 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MybP06876 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MybP06876 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MybP06876 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MybP06876 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MybP06876 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MybP06876 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MybP06876 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MybP06876 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MybP06876 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MybP06876 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MybP06876 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MybP06876 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MybP06876 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MybP06876 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MybP06876 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MybP06876 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MybP06876 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
MybP06876 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MybP06876 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MybP06876 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MybP06876 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MybP06876 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MybP06876 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MybP06876 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MybP06876 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MybP06876 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MybP06876 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MybP06876 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MybP06876 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MybP06876 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MybP06876 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MybP06876 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MybP06876 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MybP06876 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MybP06876 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MybP06876 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms