Protein–RNA interactions for Protein: P06799

Ifna7, Interferon alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna7P06799 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifna7P06799 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifna7P06799 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifna7P06799 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ifna7P06799 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifna7P06799 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ifna7P06799 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ifna7P06799 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifna7P06799 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ifna7P06799 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifna7P06799 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ifna7P06799 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifna7P06799 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifna7P06799 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifna7P06799 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifna7P06799 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ifna7P06799 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ifna7P06799 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ifna7P06799 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ifna7P06799 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ifna7P06799 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifna7P06799 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ifna7P06799 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifna7P06799 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ifna7P06799 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ifna7P06799 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ifna7P06799 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifna7P06799 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifna7P06799 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ifna7P06799 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifna7P06799 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ifna7P06799 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ifna7P06799 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifna7P06799 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ifna7P06799 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ifna7P06799 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifna7P06799 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ifna7P06799 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ifna7P06799 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ifna7P06799 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifna7P06799 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifna7P06799 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ifna7P06799 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ifna7P06799 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifna7P06799 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifna7P06799 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ifna7P06799 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ifna7P06799 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifna7P06799 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifna7P06799 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifna7P06799 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ifna7P06799 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifna7P06799 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ifna7P06799 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ifna7P06799 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifna7P06799 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ifna7P06799 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ifna7P06799 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ifna7P06799 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ifna7P06799 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifna7P06799 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ifna7P06799 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ifna7P06799 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifna7P06799 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ifna7P06799 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ifna7P06799 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ifna7P06799 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ifna7P06799 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ifna7P06799 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ifna7P06799 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifna7P06799 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ifna7P06799 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ifna7P06799 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ifna7P06799 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ifna7P06799 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifna7P06799 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ifna7P06799 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ifna7P06799 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifna7P06799 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifna7P06799 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ifna7P06799 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ifna7P06799 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifna7P06799 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifna7P06799 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ifna7P06799 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ifna7P06799 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifna7P06799 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifna7P06799 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ifna7P06799 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ifna7P06799 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifna7P06799 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ifna7P06799 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifna7P06799 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifna7P06799 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ifna7P06799 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifna7P06799 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifna7P06799 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifna7P06799 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ifna7P06799 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ifna7P06799 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms