Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P06320 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06320 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P06320 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P06320 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06320 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P06320 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06320 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06320 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P06320 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06320 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P06320 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06320 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P06320 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P06320 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06320 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06320 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P06320 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06320 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P06320 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06320 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06320 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06320 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P06320 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P06320 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P06320 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06320 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06320 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P06320 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06320 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P06320 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P06320 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06320 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P06320 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P06320 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
P06320 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06320 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P06320 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06320 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06320 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06320 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06320 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P06320 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06320 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P06320 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06320 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06320 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06320 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P06320 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P06320 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06320 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06320 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06320 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P06320 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P06320 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P06320 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P06320 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06320 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P06320 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P06320 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06320 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06320 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P06320 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06320 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06320 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06320 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06320 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P06320 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P06320 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06320 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P06320 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P06320 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06320 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06320 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P06320 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06320 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06320 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06320 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06320 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06320 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06320 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06320 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06320 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06320 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06320 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06320 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06320 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06320 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06320 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06320 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P06320 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06320 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06320 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06320 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06320 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06320 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06320 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06320 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06320 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
P06320 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms