Protein–RNA interactions for Protein: P05214

Tuba3a, Tubulin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba3aP05214 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tuba3aP05214 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tuba3aP05214 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tuba3aP05214 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tuba3aP05214 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tuba3aP05214 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tuba3aP05214 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tuba3aP05214 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tuba3aP05214 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tuba3aP05214 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tuba3aP05214 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tuba3aP05214 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tuba3aP05214 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tuba3aP05214 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tuba3aP05214 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tuba3aP05214 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tuba3aP05214 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tuba3aP05214 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tuba3aP05214 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tuba3aP05214 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tuba3aP05214 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tuba3aP05214 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tuba3aP05214 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tuba3aP05214 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tuba3aP05214 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tuba3aP05214 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tuba3aP05214 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tuba3aP05214 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tuba3aP05214 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tuba3aP05214 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tuba3aP05214 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tuba3aP05214 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tuba3aP05214 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tuba3aP05214 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tuba3aP05214 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tuba3aP05214 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tuba3aP05214 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tuba3aP05214 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tuba3aP05214 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tuba3aP05214 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tuba3aP05214 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tuba3aP05214 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tuba3aP05214 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tuba3aP05214 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tuba3aP05214 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tuba3aP05214 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tuba3aP05214 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tuba3aP05214 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tuba3aP05214 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tuba3aP05214 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tuba3aP05214 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tuba3aP05214 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tuba3aP05214 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tuba3aP05214 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tuba3aP05214 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tuba3aP05214 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tuba3aP05214 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tuba3aP05214 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tuba3aP05214 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tuba3aP05214 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tuba3aP05214 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tuba3aP05214 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tuba3aP05214 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tuba3aP05214 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tuba3aP05214 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tuba3aP05214 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tuba3aP05214 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tuba3aP05214 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tuba3aP05214 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tuba3aP05214 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tuba3aP05214 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tuba3aP05214 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tuba3aP05214 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tuba3aP05214 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tuba3aP05214 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tuba3aP05214 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tuba3aP05214 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tuba3aP05214 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tuba3aP05214 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tuba3aP05214 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tuba3aP05214 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tuba3aP05214 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tuba3aP05214 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tuba3aP05214 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tuba3aP05214 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tuba3aP05214 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tuba3aP05214 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tuba3aP05214 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tuba3aP05214 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tuba3aP05214 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tuba3aP05214 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tuba3aP05214 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tuba3aP05214 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tuba3aP05214 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tuba3aP05214 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tuba3aP05214 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tuba3aP05214 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tuba3aP05214 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tuba3aP05214 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tuba3aP05214 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms