Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3pxd2aO89032 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sh3pxd2aO89032 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sh3pxd2aO89032 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3pxd2aO89032 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3pxd2aO89032 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3pxd2aO89032 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh3pxd2aO89032 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh3pxd2aO89032 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh3pxd2aO89032 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3pxd2aO89032 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3pxd2aO89032 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3pxd2aO89032 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3pxd2aO89032 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sh3pxd2aO89032 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sh3pxd2aO89032 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sh3pxd2aO89032 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sh3pxd2aO89032 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3pxd2aO89032 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3pxd2aO89032 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3pxd2aO89032 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3pxd2aO89032 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3pxd2aO89032 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh3pxd2aO89032 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh3pxd2aO89032 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3pxd2aO89032 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3pxd2aO89032 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sh3pxd2aO89032 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sh3pxd2aO89032 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3pxd2aO89032 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3pxd2aO89032 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3pxd2aO89032 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3pxd2aO89032 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3pxd2aO89032 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3pxd2aO89032 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3pxd2aO89032 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3pxd2aO89032 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh3pxd2aO89032 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh3pxd2aO89032 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sh3pxd2aO89032 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3pxd2aO89032 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3pxd2aO89032 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3pxd2aO89032 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3pxd2aO89032 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3pxd2aO89032 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh3pxd2aO89032 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3pxd2aO89032 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh3pxd2aO89032 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3pxd2aO89032 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3pxd2aO89032 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3pxd2aO89032 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3pxd2aO89032 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sh3pxd2aO89032 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh3pxd2aO89032 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh3pxd2aO89032 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3pxd2aO89032 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh3pxd2aO89032 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3pxd2aO89032 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3pxd2aO89032 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3pxd2aO89032 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3pxd2aO89032 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3pxd2aO89032 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3pxd2aO89032 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3pxd2aO89032 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3pxd2aO89032 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3pxd2aO89032 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3pxd2aO89032 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3pxd2aO89032 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sh3pxd2aO89032 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sh3pxd2aO89032 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3pxd2aO89032 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3pxd2aO89032 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3pxd2aO89032 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3pxd2aO89032 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3pxd2aO89032 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3pxd2aO89032 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3pxd2aO89032 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3pxd2aO89032 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3pxd2aO89032 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3pxd2aO89032 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3pxd2aO89032 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3pxd2aO89032 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3pxd2aO89032 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3pxd2aO89032 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3pxd2aO89032 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3pxd2aO89032 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3pxd2aO89032 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3pxd2aO89032 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3pxd2aO89032 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3pxd2aO89032 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3pxd2aO89032 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3pxd2aO89032 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3pxd2aO89032 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3pxd2aO89032 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3pxd2aO89032 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3pxd2aO89032 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3pxd2aO89032 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3pxd2aO89032 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3pxd2aO89032 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3pxd2aO89032 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms