Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcn2O88968 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcn2O88968 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcn2O88968 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcn2O88968 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcn2O88968 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcn2O88968 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcn2O88968 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcn2O88968 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcn2O88968 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcn2O88968 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcn2O88968 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcn2O88968 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcn2O88968 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcn2O88968 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcn2O88968 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcn2O88968 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcn2O88968 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcn2O88968 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tcn2O88968 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tcn2O88968 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcn2O88968 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tcn2O88968 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tcn2O88968 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tcn2O88968 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tcn2O88968 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tcn2O88968 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tcn2O88968 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tcn2O88968 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tcn2O88968 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcn2O88968 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcn2O88968 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcn2O88968 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tcn2O88968 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcn2O88968 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcn2O88968 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcn2O88968 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcn2O88968 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcn2O88968 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcn2O88968 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcn2O88968 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcn2O88968 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcn2O88968 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcn2O88968 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcn2O88968 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcn2O88968 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcn2O88968 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcn2O88968 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcn2O88968 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcn2O88968 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcn2O88968 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcn2O88968 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcn2O88968 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcn2O88968 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcn2O88968 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcn2O88968 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcn2O88968 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcn2O88968 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcn2O88968 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcn2O88968 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcn2O88968 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcn2O88968 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcn2O88968 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcn2O88968 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcn2O88968 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcn2O88968 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcn2O88968 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcn2O88968 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcn2O88968 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcn2O88968 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcn2O88968 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcn2O88968 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcn2O88968 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcn2O88968 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcn2O88968 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcn2O88968 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcn2O88968 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tcn2O88968 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcn2O88968 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcn2O88968 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcn2O88968 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcn2O88968 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcn2O88968 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcn2O88968 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcn2O88968 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcn2O88968 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcn2O88968 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcn2O88968 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tcn2O88968 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcn2O88968 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tcn2O88968 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcn2O88968 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcn2O88968 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcn2O88968 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcn2O88968 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcn2O88968 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcn2O88968 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcn2O88968 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcn2O88968 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcn2O88968 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms