Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Kdm6aO70546 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Kdm6aO70546 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Kdm6aO70546 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Kdm6aO70546 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Kdm6aO70546 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Kdm6aO70546 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Kdm6aO70546 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Kdm6aO70546 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Kdm6aO70546 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Kdm6aO70546 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Kdm6aO70546 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Kdm6aO70546 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Kdm6aO70546 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Kdm6aO70546 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Kdm6aO70546 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Kdm6aO70546 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Kdm6aO70546 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Kdm6aO70546 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Kdm6aO70546 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Kdm6aO70546 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Kdm6aO70546 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Kdm6aO70546 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Kdm6aO70546 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Kdm6aO70546 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Kdm6aO70546 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Kdm6aO70546 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Kdm6aO70546 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Kdm6aO70546 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Kdm6aO70546 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Kdm6aO70546 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Kdm6aO70546 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Kdm6aO70546 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Kdm6aO70546 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Kdm6aO70546 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Kdm6aO70546 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Kdm6aO70546 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Kdm6aO70546 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Kdm6aO70546 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Kdm6aO70546 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Kdm6aO70546 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Kdm6aO70546 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Kdm6aO70546 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Kdm6aO70546 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Kdm6aO70546 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Kdm6aO70546 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Kdm6aO70546 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Kdm6aO70546 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Kdm6aO70546 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Kdm6aO70546 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm6aO70546 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Kdm6aO70546 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Kdm6aO70546 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Kdm6aO70546 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm6aO70546 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Kdm6aO70546 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Kdm6aO70546 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Kdm6aO70546 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Kdm6aO70546 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Kdm6aO70546 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Kdm6aO70546 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Kdm6aO70546 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Kdm6aO70546 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Kdm6aO70546 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Kdm6aO70546 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Kdm6aO70546 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Kdm6aO70546 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Kdm6aO70546 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Kdm6aO70546 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Kdm6aO70546 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Kdm6aO70546 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Kdm6aO70546 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Kdm6aO70546 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Kdm6aO70546 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Kdm6aO70546 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Kdm6aO70546 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Kdm6aO70546 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm6aO70546 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Kdm6aO70546 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kdm6aO70546 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kdm6aO70546 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Kdm6aO70546 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Kdm6aO70546 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Kdm6aO70546 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Kdm6aO70546 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Kdm6aO70546 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Kdm6aO70546 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm6aO70546 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm6aO70546 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm6aO70546 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm6aO70546 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm6aO70546 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm6aO70546 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm6aO70546 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Kdm6aO70546 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Kdm6aO70546 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Kdm6aO70546 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm6aO70546 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Kdm6aO70546 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Kdm6aO70546 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms