Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SgceO70258 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SgceO70258 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SgceO70258 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SgceO70258 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SgceO70258 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SgceO70258 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SgceO70258 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SgceO70258 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SgceO70258 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SgceO70258 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SgceO70258 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SgceO70258 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SgceO70258 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SgceO70258 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SgceO70258 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SgceO70258 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SgceO70258 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SgceO70258 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SgceO70258 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SgceO70258 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SgceO70258 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SgceO70258 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SgceO70258 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SgceO70258 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SgceO70258 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SgceO70258 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SgceO70258 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SgceO70258 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SgceO70258 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SgceO70258 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SgceO70258 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SgceO70258 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SgceO70258 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SgceO70258 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SgceO70258 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SgceO70258 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SgceO70258 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SgceO70258 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SgceO70258 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SgceO70258 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SgceO70258 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SgceO70258 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SgceO70258 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SgceO70258 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SgceO70258 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SgceO70258 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SgceO70258 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SgceO70258 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SgceO70258 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SgceO70258 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SgceO70258 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SgceO70258 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SgceO70258 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SgceO70258 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SgceO70258 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SgceO70258 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SgceO70258 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SgceO70258 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SgceO70258 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SgceO70258 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SgceO70258 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SgceO70258 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SgceO70258 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SgceO70258 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SgceO70258 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SgceO70258 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SgceO70258 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SgceO70258 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SgceO70258 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SgceO70258 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SgceO70258 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SgceO70258 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SgceO70258 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SgceO70258 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SgceO70258 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SgceO70258 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SgceO70258 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SgceO70258 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SgceO70258 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SgceO70258 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SgceO70258 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SgceO70258 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SgceO70258 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SgceO70258 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SgceO70258 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SgceO70258 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SgceO70258 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SgceO70258 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SgceO70258 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SgceO70258 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SgceO70258 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SgceO70258 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SgceO70258 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SgceO70258 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SgceO70258 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SgceO70258 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SgceO70258 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SgceO70258 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SgceO70258 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms