Protein–RNA interactions for Protein: O54984

Asna1, ATPase Asna1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asna1O54984 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Asna1O54984 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Asna1O54984 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Asna1O54984 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Asna1O54984 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Asna1O54984 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Asna1O54984 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Asna1O54984 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Asna1O54984 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Asna1O54984 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Asna1O54984 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Asna1O54984 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Asna1O54984 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Asna1O54984 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Asna1O54984 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Asna1O54984 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Asna1O54984 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Asna1O54984 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Asna1O54984 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Asna1O54984 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Asna1O54984 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Asna1O54984 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Asna1O54984 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Asna1O54984 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Asna1O54984 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Asna1O54984 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Asna1O54984 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Asna1O54984 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Asna1O54984 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Asna1O54984 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Asna1O54984 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Asna1O54984 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Asna1O54984 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Asna1O54984 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Asna1O54984 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Asna1O54984 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Asna1O54984 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Asna1O54984 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Asna1O54984 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Asna1O54984 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Asna1O54984 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Asna1O54984 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Asna1O54984 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Asna1O54984 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Asna1O54984 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Asna1O54984 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Asna1O54984 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Asna1O54984 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Asna1O54984 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Asna1O54984 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Asna1O54984 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Asna1O54984 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Asna1O54984 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Asna1O54984 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Asna1O54984 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Asna1O54984 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Asna1O54984 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Asna1O54984 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Asna1O54984 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Asna1O54984 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Asna1O54984 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Asna1O54984 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Asna1O54984 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Asna1O54984 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Asna1O54984 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Asna1O54984 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Asna1O54984 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Asna1O54984 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Asna1O54984 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Asna1O54984 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Asna1O54984 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Asna1O54984 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Asna1O54984 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Asna1O54984 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Asna1O54984 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Asna1O54984 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Asna1O54984 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Asna1O54984 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Asna1O54984 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Asna1O54984 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Asna1O54984 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Asna1O54984 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Asna1O54984 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Asna1O54984 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Asna1O54984 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Asna1O54984 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Asna1O54984 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Asna1O54984 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Asna1O54984 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Asna1O54984 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Asna1O54984 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Asna1O54984 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Asna1O54984 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Asna1O54984 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Asna1O54984 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Asna1O54984 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Asna1O54984 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Asna1O54984 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Asna1O54984 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Asna1O54984 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms