Protein–RNA interactions for Protein: O54864

Suv39h1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suv39h1O54864 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Suv39h1O54864 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Suv39h1O54864 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Suv39h1O54864 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Suv39h1O54864 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Suv39h1O54864 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Suv39h1O54864 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Suv39h1O54864 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Suv39h1O54864 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Suv39h1O54864 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Suv39h1O54864 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Suv39h1O54864 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Suv39h1O54864 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Suv39h1O54864 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Suv39h1O54864 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Suv39h1O54864 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Suv39h1O54864 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Suv39h1O54864 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Suv39h1O54864 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Suv39h1O54864 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Suv39h1O54864 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Suv39h1O54864 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Suv39h1O54864 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Suv39h1O54864 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Suv39h1O54864 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Suv39h1O54864 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Suv39h1O54864 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Suv39h1O54864 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Suv39h1O54864 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Suv39h1O54864 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Suv39h1O54864 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Suv39h1O54864 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Suv39h1O54864 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Suv39h1O54864 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Suv39h1O54864 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Suv39h1O54864 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Suv39h1O54864 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Suv39h1O54864 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Suv39h1O54864 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Suv39h1O54864 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Suv39h1O54864 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Suv39h1O54864 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Suv39h1O54864 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Suv39h1O54864 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Suv39h1O54864 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Suv39h1O54864 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Suv39h1O54864 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Suv39h1O54864 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Suv39h1O54864 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Suv39h1O54864 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Suv39h1O54864 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Suv39h1O54864 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Suv39h1O54864 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Suv39h1O54864 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Suv39h1O54864 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Suv39h1O54864 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Suv39h1O54864 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Suv39h1O54864 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Suv39h1O54864 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Suv39h1O54864 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Suv39h1O54864 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Suv39h1O54864 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Suv39h1O54864 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Suv39h1O54864 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Suv39h1O54864 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Suv39h1O54864 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Suv39h1O54864 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Suv39h1O54864 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Suv39h1O54864 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Suv39h1O54864 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Suv39h1O54864 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Suv39h1O54864 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Suv39h1O54864 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Suv39h1O54864 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Suv39h1O54864 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Suv39h1O54864 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Suv39h1O54864 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Suv39h1O54864 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Suv39h1O54864 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Suv39h1O54864 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Suv39h1O54864 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Suv39h1O54864 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Suv39h1O54864 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Suv39h1O54864 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Suv39h1O54864 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Suv39h1O54864 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Suv39h1O54864 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Suv39h1O54864 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Suv39h1O54864 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Suv39h1O54864 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Suv39h1O54864 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Suv39h1O54864 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Suv39h1O54864 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Suv39h1O54864 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Suv39h1O54864 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Suv39h1O54864 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Suv39h1O54864 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Suv39h1O54864 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Suv39h1O54864 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Suv39h1O54864 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms