Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DffbO54788 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DffbO54788 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DffbO54788 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DffbO54788 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DffbO54788 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DffbO54788 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DffbO54788 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DffbO54788 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DffbO54788 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DffbO54788 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DffbO54788 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DffbO54788 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DffbO54788 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DffbO54788 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DffbO54788 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DffbO54788 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DffbO54788 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DffbO54788 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DffbO54788 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DffbO54788 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DffbO54788 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DffbO54788 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DffbO54788 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DffbO54788 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DffbO54788 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DffbO54788 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DffbO54788 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DffbO54788 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DffbO54788 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DffbO54788 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DffbO54788 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DffbO54788 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DffbO54788 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DffbO54788 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DffbO54788 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DffbO54788 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DffbO54788 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DffbO54788 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DffbO54788 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DffbO54788 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DffbO54788 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DffbO54788 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DffbO54788 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DffbO54788 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DffbO54788 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DffbO54788 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DffbO54788 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DffbO54788 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DffbO54788 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DffbO54788 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DffbO54788 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DffbO54788 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DffbO54788 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DffbO54788 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DffbO54788 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DffbO54788 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DffbO54788 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DffbO54788 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DffbO54788 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DffbO54788 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DffbO54788 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DffbO54788 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DffbO54788 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DffbO54788 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DffbO54788 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DffbO54788 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DffbO54788 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DffbO54788 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DffbO54788 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DffbO54788 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DffbO54788 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DffbO54788 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DffbO54788 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DffbO54788 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DffbO54788 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DffbO54788 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DffbO54788 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DffbO54788 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DffbO54788 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DffbO54788 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DffbO54788 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DffbO54788 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DffbO54788 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DffbO54788 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DffbO54788 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DffbO54788 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DffbO54788 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DffbO54788 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DffbO54788 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DffbO54788 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DffbO54788 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DffbO54788 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DffbO54788 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DffbO54788 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DffbO54788 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DffbO54788 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DffbO54788 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DffbO54788 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DffbO54788 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms