Protein–RNA interactions for Protein: O35375

Nrp2, Neuropilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrp2O35375 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nrp2O35375 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nrp2O35375 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nrp2O35375 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nrp2O35375 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nrp2O35375 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nrp2O35375 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nrp2O35375 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nrp2O35375 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nrp2O35375 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nrp2O35375 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nrp2O35375 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nrp2O35375 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nrp2O35375 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nrp2O35375 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrp2O35375 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrp2O35375 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrp2O35375 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrp2O35375 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nrp2O35375 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Nrp2O35375 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nrp2O35375 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nrp2O35375 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrp2O35375 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrp2O35375 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrp2O35375 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nrp2O35375 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrp2O35375 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrp2O35375 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrp2O35375 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrp2O35375 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrp2O35375 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrp2O35375 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrp2O35375 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrp2O35375 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrp2O35375 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nrp2O35375 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nrp2O35375 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nrp2O35375 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrp2O35375 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrp2O35375 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nrp2O35375 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nrp2O35375 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nrp2O35375 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nrp2O35375 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nrp2O35375 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nrp2O35375 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nrp2O35375 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nrp2O35375 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nrp2O35375 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nrp2O35375 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nrp2O35375 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nrp2O35375 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nrp2O35375 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nrp2O35375 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nrp2O35375 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nrp2O35375 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nrp2O35375 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nrp2O35375 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nrp2O35375 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nrp2O35375 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nrp2O35375 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nrp2O35375 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nrp2O35375 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nrp2O35375 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nrp2O35375 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nrp2O35375 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nrp2O35375 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nrp2O35375 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nrp2O35375 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nrp2O35375 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nrp2O35375 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nrp2O35375 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nrp2O35375 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nrp2O35375 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nrp2O35375 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nrp2O35375 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nrp2O35375 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nrp2O35375 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nrp2O35375 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nrp2O35375 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nrp2O35375 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nrp2O35375 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nrp2O35375 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nrp2O35375 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nrp2O35375 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nrp2O35375 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nrp2O35375 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nrp2O35375 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nrp2O35375 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nrp2O35375 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nrp2O35375 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nrp2O35375 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nrp2O35375 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nrp2O35375 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nrp2O35375 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nrp2O35375 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nrp2O35375 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nrp2O35375 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nrp2O35375 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms