Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RrhO35214 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RrhO35214 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RrhO35214 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RrhO35214 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RrhO35214 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RrhO35214 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RrhO35214 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RrhO35214 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RrhO35214 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RrhO35214 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RrhO35214 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RrhO35214 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RrhO35214 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RrhO35214 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RrhO35214 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RrhO35214 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RrhO35214 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RrhO35214 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RrhO35214 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RrhO35214 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RrhO35214 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RrhO35214 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RrhO35214 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RrhO35214 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RrhO35214 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RrhO35214 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RrhO35214 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RrhO35214 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RrhO35214 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RrhO35214 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RrhO35214 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RrhO35214 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RrhO35214 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RrhO35214 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RrhO35214 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RrhO35214 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RrhO35214 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RrhO35214 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RrhO35214 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RrhO35214 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RrhO35214 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RrhO35214 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RrhO35214 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RrhO35214 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RrhO35214 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RrhO35214 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RrhO35214 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RrhO35214 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RrhO35214 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RrhO35214 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RrhO35214 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RrhO35214 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RrhO35214 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RrhO35214 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RrhO35214 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RrhO35214 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RrhO35214 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RrhO35214 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RrhO35214 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RrhO35214 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RrhO35214 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RrhO35214 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RrhO35214 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RrhO35214 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RrhO35214 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RrhO35214 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RrhO35214 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RrhO35214 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RrhO35214 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RrhO35214 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RrhO35214 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RrhO35214 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RrhO35214 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RrhO35214 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RrhO35214 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RrhO35214 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RrhO35214 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RrhO35214 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RrhO35214 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RrhO35214 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RrhO35214 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RrhO35214 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RrhO35214 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RrhO35214 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RrhO35214 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RrhO35214 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RrhO35214 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RrhO35214 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RrhO35214 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RrhO35214 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RrhO35214 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RrhO35214 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RrhO35214 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RrhO35214 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RrhO35214 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RrhO35214 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RrhO35214 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RrhO35214 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RrhO35214 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms