Protein–RNA interactions for Protein: O09061

Psmb1, Proteasome subunit beta type-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb1O09061 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psmb1O09061 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psmb1O09061 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmb1O09061 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psmb1O09061 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Psmb1O09061 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Psmb1O09061 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmb1O09061 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmb1O09061 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psmb1O09061 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmb1O09061 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psmb1O09061 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psmb1O09061 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Psmb1O09061 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmb1O09061 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmb1O09061 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmb1O09061 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmb1O09061 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmb1O09061 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmb1O09061 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmb1O09061 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmb1O09061 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmb1O09061 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmb1O09061 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmb1O09061 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmb1O09061 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmb1O09061 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmb1O09061 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmb1O09061 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmb1O09061 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmb1O09061 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmb1O09061 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmb1O09061 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmb1O09061 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmb1O09061 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmb1O09061 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmb1O09061 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmb1O09061 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmb1O09061 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmb1O09061 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmb1O09061 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmb1O09061 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmb1O09061 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmb1O09061 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmb1O09061 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmb1O09061 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmb1O09061 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmb1O09061 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmb1O09061 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmb1O09061 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmb1O09061 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmb1O09061 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmb1O09061 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmb1O09061 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmb1O09061 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmb1O09061 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmb1O09061 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmb1O09061 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmb1O09061 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmb1O09061 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmb1O09061 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmb1O09061 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmb1O09061 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmb1O09061 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmb1O09061 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmb1O09061 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmb1O09061 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmb1O09061 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmb1O09061 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmb1O09061 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmb1O09061 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmb1O09061 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmb1O09061 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmb1O09061 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmb1O09061 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmb1O09061 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmb1O09061 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmb1O09061 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmb1O09061 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmb1O09061 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmb1O09061 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmb1O09061 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmb1O09061 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmb1O09061 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmb1O09061 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmb1O09061 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmb1O09061 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmb1O09061 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Psmb1O09061 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmb1O09061 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmb1O09061 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmb1O09061 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmb1O09061 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmb1O09061 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmb1O09061 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmb1O09061 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmb1O09061 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmb1O09061 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmb1O09061 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmb1O09061 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms