Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PrkcshO08795 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PrkcshO08795 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PrkcshO08795 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PrkcshO08795 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PrkcshO08795 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PrkcshO08795 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PrkcshO08795 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PrkcshO08795 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PrkcshO08795 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PrkcshO08795 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PrkcshO08795 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PrkcshO08795 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PrkcshO08795 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PrkcshO08795 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PrkcshO08795 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PrkcshO08795 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PrkcshO08795 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
PrkcshO08795 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PrkcshO08795 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PrkcshO08795 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PrkcshO08795 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PrkcshO08795 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PrkcshO08795 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PrkcshO08795 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PrkcshO08795 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PrkcshO08795 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PrkcshO08795 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PrkcshO08795 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PrkcshO08795 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PrkcshO08795 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PrkcshO08795 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PrkcshO08795 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PrkcshO08795 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PrkcshO08795 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PrkcshO08795 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PrkcshO08795 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PrkcshO08795 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PrkcshO08795 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PrkcshO08795 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PrkcshO08795 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PrkcshO08795 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
PrkcshO08795 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PrkcshO08795 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PrkcshO08795 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PrkcshO08795 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PrkcshO08795 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PrkcshO08795 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PrkcshO08795 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PrkcshO08795 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PrkcshO08795 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PrkcshO08795 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PrkcshO08795 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PrkcshO08795 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PrkcshO08795 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PrkcshO08795 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PrkcshO08795 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PrkcshO08795 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PrkcshO08795 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PrkcshO08795 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PrkcshO08795 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PrkcshO08795 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PrkcshO08795 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PrkcshO08795 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PrkcshO08795 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PrkcshO08795 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PrkcshO08795 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PrkcshO08795 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PrkcshO08795 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PrkcshO08795 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PrkcshO08795 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PrkcshO08795 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PrkcshO08795 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PrkcshO08795 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PrkcshO08795 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PrkcshO08795 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PrkcshO08795 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PrkcshO08795 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PrkcshO08795 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PrkcshO08795 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PrkcshO08795 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PrkcshO08795 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PrkcshO08795 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PrkcshO08795 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PrkcshO08795 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PrkcshO08795 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PrkcshO08795 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PrkcshO08795 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PrkcshO08795 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PrkcshO08795 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PrkcshO08795 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PrkcshO08795 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PrkcshO08795 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PrkcshO08795 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PrkcshO08795 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PrkcshO08795 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PrkcshO08795 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PrkcshO08795 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PrkcshO08795 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PrkcshO08795 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms